Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z184

Padi3, Protein-arginine deiminase type-3, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi3Q9Z184 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Padi3Q9Z184 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Padi3Q9Z184 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Padi3Q9Z184 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Padi3Q9Z184 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Padi3Q9Z184 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Padi3Q9Z184 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Padi3Q9Z184 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Padi3Q9Z184 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Padi3Q9Z184 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Padi3Q9Z184 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Padi3Q9Z184 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Padi3Q9Z184 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Padi3Q9Z184 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Padi3Q9Z184 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Padi3Q9Z184 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Padi3Q9Z184 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Padi3Q9Z184 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Padi3Q9Z184 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Padi3Q9Z184 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Padi3Q9Z184 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Padi3Q9Z184 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Padi3Q9Z184 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Padi3Q9Z184 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Padi3Q9Z184 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Padi3Q9Z184 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Padi3Q9Z184 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Padi3Q9Z184 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Padi3Q9Z184 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Padi3Q9Z184 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Padi3Q9Z184 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Padi3Q9Z184 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Padi3Q9Z184 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Padi3Q9Z184 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Padi3Q9Z184 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Padi3Q9Z184 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Padi3Q9Z184 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Padi3Q9Z184 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Padi3Q9Z184 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Padi3Q9Z184 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Padi3Q9Z184 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Padi3Q9Z184 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Padi3Q9Z184 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Padi3Q9Z184 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Padi3Q9Z184 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Padi3Q9Z184 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Padi3Q9Z184 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Padi3Q9Z184 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Padi3Q9Z184 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Padi3Q9Z184 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Padi3Q9Z184 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Padi3Q9Z184 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Padi3Q9Z184 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Padi3Q9Z184 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Padi3Q9Z184 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Padi3Q9Z184 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Padi3Q9Z184 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Padi3Q9Z184 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Padi3Q9Z184 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Padi3Q9Z184 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Padi3Q9Z184 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Padi3Q9Z184 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Padi3Q9Z184 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Padi3Q9Z184 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Padi3Q9Z184 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Padi3Q9Z184 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Padi3Q9Z184 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Padi3Q9Z184 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Padi3Q9Z184 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Padi3Q9Z184 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Padi3Q9Z184 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Padi3Q9Z184 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Padi3Q9Z184 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Padi3Q9Z184 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Padi3Q9Z184 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Padi3Q9Z184 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Padi3Q9Z184 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Padi3Q9Z184 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Padi3Q9Z184 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Padi3Q9Z184 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Padi3Q9Z184 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Padi3Q9Z184 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Padi3Q9Z184 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Padi3Q9Z184 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Padi3Q9Z184 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Padi3Q9Z184 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Padi3Q9Z184 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Padi3Q9Z184 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Padi3Q9Z184 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Padi3Q9Z184 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Padi3Q9Z184 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Padi3Q9Z184 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Padi3Q9Z184 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Padi3Q9Z184 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Padi3Q9Z184 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Padi3Q9Z184 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Padi3Q9Z184 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Padi3Q9Z184 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Padi3Q9Z184 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Padi3Q9Z184 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms