Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKW4

VAV3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, humanhuman

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV3Q9UKW4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VAV3Q9UKW4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VAV3Q9UKW4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VAV3Q9UKW4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VAV3Q9UKW4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VAV3Q9UKW4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VAV3Q9UKW4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VAV3Q9UKW4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VAV3Q9UKW4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VAV3Q9UKW4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VAV3Q9UKW4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VAV3Q9UKW4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VAV3Q9UKW4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VAV3Q9UKW4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VAV3Q9UKW4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VAV3Q9UKW4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VAV3Q9UKW4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VAV3Q9UKW4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VAV3Q9UKW4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VAV3Q9UKW4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VAV3Q9UKW4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
VAV3Q9UKW4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAV3Q9UKW4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAV3Q9UKW4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VAV3Q9UKW4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VAV3Q9UKW4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VAV3Q9UKW4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
VAV3Q9UKW4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VAV3Q9UKW4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VAV3Q9UKW4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VAV3Q9UKW4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VAV3Q9UKW4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAV3Q9UKW4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAV3Q9UKW4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VAV3Q9UKW4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VAV3Q9UKW4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VAV3Q9UKW4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VAV3Q9UKW4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VAV3Q9UKW4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAV3Q9UKW4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAV3Q9UKW4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAV3Q9UKW4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAV3Q9UKW4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VAV3Q9UKW4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VAV3Q9UKW4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VAV3Q9UKW4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VAV3Q9UKW4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
VAV3Q9UKW4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
VAV3Q9UKW4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VAV3Q9UKW4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VAV3Q9UKW4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VAV3Q9UKW4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
VAV3Q9UKW4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VAV3Q9UKW4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VAV3Q9UKW4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VAV3Q9UKW4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VAV3Q9UKW4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VAV3Q9UKW4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VAV3Q9UKW4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VAV3Q9UKW4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
VAV3Q9UKW4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VAV3Q9UKW4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VAV3Q9UKW4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
VAV3Q9UKW4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VAV3Q9UKW4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VAV3Q9UKW4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VAV3Q9UKW4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VAV3Q9UKW4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VAV3Q9UKW4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VAV3Q9UKW4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
VAV3Q9UKW4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VAV3Q9UKW4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VAV3Q9UKW4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
VAV3Q9UKW4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
VAV3Q9UKW4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28■■■□□ 2.07
VAV3Q9UKW4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VAV3Q9UKW4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
VAV3Q9UKW4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VAV3Q9UKW4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VAV3Q9UKW4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
VAV3Q9UKW4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VAV3Q9UKW4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VAV3Q9UKW4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
VAV3Q9UKW4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VAV3Q9UKW4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VAV3Q9UKW4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VAV3Q9UKW4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
VAV3Q9UKW4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VAV3Q9UKW4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VAV3Q9UKW4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VAV3Q9UKW4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VAV3Q9UKW4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VAV3Q9UKW4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VAV3Q9UKW4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VAV3Q9UKW4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms