Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP25Q9UHP3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP25Q9UHP3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP25Q9UHP3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP25Q9UHP3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP25Q9UHP3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP25Q9UHP3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP25Q9UHP3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP25Q9UHP3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
USP25Q9UHP3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP25Q9UHP3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP25Q9UHP3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP25Q9UHP3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP25Q9UHP3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP25Q9UHP3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP25Q9UHP3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP25Q9UHP3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP25Q9UHP3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP25Q9UHP3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP25Q9UHP3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP25Q9UHP3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP25Q9UHP3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP25Q9UHP3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP25Q9UHP3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP25Q9UHP3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP25Q9UHP3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP25Q9UHP3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP25Q9UHP3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP25Q9UHP3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP25Q9UHP3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP25Q9UHP3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP25Q9UHP3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP25Q9UHP3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP25Q9UHP3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP25Q9UHP3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP25Q9UHP3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP25Q9UHP3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP25Q9UHP3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP25Q9UHP3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms