Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NXF1Q9UBU9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NXF1Q9UBU9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NXF1Q9UBU9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NXF1Q9UBU9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NXF1Q9UBU9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NXF1Q9UBU9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NXF1Q9UBU9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NXF1Q9UBU9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NXF1Q9UBU9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NXF1Q9UBU9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NXF1Q9UBU9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NXF1Q9UBU9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NXF1Q9UBU9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NXF1Q9UBU9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NXF1Q9UBU9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NXF1Q9UBU9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NXF1Q9UBU9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NXF1Q9UBU9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms