Protein–RNA interactions for Protein: Q9P217

ZSWIM5, Zinc finger SWIM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM5Q9P217 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZSWIM5Q9P217 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZSWIM5Q9P217 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZSWIM5Q9P217 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZSWIM5Q9P217 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZSWIM5Q9P217 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZSWIM5Q9P217 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZSWIM5Q9P217 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZSWIM5Q9P217 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZSWIM5Q9P217 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZSWIM5Q9P217 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZSWIM5Q9P217 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZSWIM5Q9P217 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZSWIM5Q9P217 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZSWIM5Q9P217 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZSWIM5Q9P217 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZSWIM5Q9P217 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZSWIM5Q9P217 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZSWIM5Q9P217 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZSWIM5Q9P217 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZSWIM5Q9P217 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZSWIM5Q9P217 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZSWIM5Q9P217 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZSWIM5Q9P217 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZSWIM5Q9P217 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZSWIM5Q9P217 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZSWIM5Q9P217 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZSWIM5Q9P217 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZSWIM5Q9P217 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZSWIM5Q9P217 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZSWIM5Q9P217 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZSWIM5Q9P217 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZSWIM5Q9P217 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZSWIM5Q9P217 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZSWIM5Q9P217 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZSWIM5Q9P217 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZSWIM5Q9P217 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZSWIM5Q9P217 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZSWIM5Q9P217 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZSWIM5Q9P217 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZSWIM5Q9P217 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZSWIM5Q9P217 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ZSWIM5Q9P217 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZSWIM5Q9P217 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ZSWIM5Q9P217 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZSWIM5Q9P217 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ZSWIM5Q9P217 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZSWIM5Q9P217 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZSWIM5Q9P217 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZSWIM5Q9P217 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZSWIM5Q9P217 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZSWIM5Q9P217 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ZSWIM5Q9P217 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZSWIM5Q9P217 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ZSWIM5Q9P217 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZSWIM5Q9P217 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZSWIM5Q9P217 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZSWIM5Q9P217 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZSWIM5Q9P217 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZSWIM5Q9P217 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ZSWIM5Q9P217 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZSWIM5Q9P217 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZSWIM5Q9P217 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZSWIM5Q9P217 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZSWIM5Q9P217 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZSWIM5Q9P217 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms