Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRTAC1Q9NQ79 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRTAC1Q9NQ79 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRTAC1Q9NQ79 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRTAC1Q9NQ79 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRTAC1Q9NQ79 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRTAC1Q9NQ79 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRTAC1Q9NQ79 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CRTAC1Q9NQ79 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRTAC1Q9NQ79 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRTAC1Q9NQ79 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRTAC1Q9NQ79 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CRTAC1Q9NQ79 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRTAC1Q9NQ79 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRTAC1Q9NQ79 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRTAC1Q9NQ79 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRTAC1Q9NQ79 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRTAC1Q9NQ79 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRTAC1Q9NQ79 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRTAC1Q9NQ79 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRTAC1Q9NQ79 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRTAC1Q9NQ79 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRTAC1Q9NQ79 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CRTAC1Q9NQ79 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CRTAC1Q9NQ79 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CRTAC1Q9NQ79 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRTAC1Q9NQ79 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRTAC1Q9NQ79 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRTAC1Q9NQ79 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRTAC1Q9NQ79 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRTAC1Q9NQ79 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRTAC1Q9NQ79 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CRTAC1Q9NQ79 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRTAC1Q9NQ79 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRTAC1Q9NQ79 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRTAC1Q9NQ79 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRTAC1Q9NQ79 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRTAC1Q9NQ79 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRTAC1Q9NQ79 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CRTAC1Q9NQ79 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRTAC1Q9NQ79 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CRTAC1Q9NQ79 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRTAC1Q9NQ79 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRTAC1Q9NQ79 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRTAC1Q9NQ79 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRTAC1Q9NQ79 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CRTAC1Q9NQ79 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRTAC1Q9NQ79 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRTAC1Q9NQ79 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRTAC1Q9NQ79 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRTAC1Q9NQ79 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRTAC1Q9NQ79 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRTAC1Q9NQ79 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRTAC1Q9NQ79 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRTAC1Q9NQ79 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRTAC1Q9NQ79 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CRTAC1Q9NQ79 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms