Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA2

Cog8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog8Q9JJA2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cog8Q9JJA2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cog8Q9JJA2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cog8Q9JJA2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cog8Q9JJA2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cog8Q9JJA2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cog8Q9JJA2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cog8Q9JJA2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cog8Q9JJA2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cog8Q9JJA2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cog8Q9JJA2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cog8Q9JJA2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cog8Q9JJA2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cog8Q9JJA2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cog8Q9JJA2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cog8Q9JJA2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cog8Q9JJA2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cog8Q9JJA2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cog8Q9JJA2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cog8Q9JJA2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cog8Q9JJA2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cog8Q9JJA2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cog8Q9JJA2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cog8Q9JJA2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cog8Q9JJA2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cog8Q9JJA2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cog8Q9JJA2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cog8Q9JJA2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cog8Q9JJA2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cog8Q9JJA2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cog8Q9JJA2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cog8Q9JJA2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cog8Q9JJA2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cog8Q9JJA2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cog8Q9JJA2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cog8Q9JJA2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cog8Q9JJA2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cog8Q9JJA2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cog8Q9JJA2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cog8Q9JJA2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cog8Q9JJA2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cog8Q9JJA2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cog8Q9JJA2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cog8Q9JJA2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cog8Q9JJA2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cog8Q9JJA2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cog8Q9JJA2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cog8Q9JJA2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cog8Q9JJA2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cog8Q9JJA2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cog8Q9JJA2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cog8Q9JJA2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cog8Q9JJA2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cog8Q9JJA2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cog8Q9JJA2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cog8Q9JJA2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cog8Q9JJA2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cog8Q9JJA2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cog8Q9JJA2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cog8Q9JJA2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cog8Q9JJA2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cog8Q9JJA2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cog8Q9JJA2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cog8Q9JJA2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cog8Q9JJA2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cog8Q9JJA2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cog8Q9JJA2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cog8Q9JJA2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cog8Q9JJA2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cog8Q9JJA2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cog8Q9JJA2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cog8Q9JJA2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cog8Q9JJA2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cog8Q9JJA2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cog8Q9JJA2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cog8Q9JJA2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cog8Q9JJA2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cog8Q9JJA2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cog8Q9JJA2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cog8Q9JJA2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cog8Q9JJA2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cog8Q9JJA2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cog8Q9JJA2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cog8Q9JJA2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cog8Q9JJA2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cog8Q9JJA2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cog8Q9JJA2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cog8Q9JJA2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cog8Q9JJA2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cog8Q9JJA2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cog8Q9JJA2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cog8Q9JJA2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cog8Q9JJA2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cog8Q9JJA2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cog8Q9JJA2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cog8Q9JJA2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cog8Q9JJA2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms