Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL5

Tulp4, Tubby-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp4Q9JIL5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Tulp4Q9JIL5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Tulp4Q9JIL5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Tulp4Q9JIL5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Tulp4Q9JIL5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Tulp4Q9JIL5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Tulp4Q9JIL5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Tulp4Q9JIL5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Tulp4Q9JIL5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Tulp4Q9JIL5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Tulp4Q9JIL5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Tulp4Q9JIL5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Tulp4Q9JIL5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Tulp4Q9JIL5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Tulp4Q9JIL5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Tulp4Q9JIL5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Tulp4Q9JIL5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Tulp4Q9JIL5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Tulp4Q9JIL5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Tulp4Q9JIL5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Tulp4Q9JIL5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Tulp4Q9JIL5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Tulp4Q9JIL5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Tulp4Q9JIL5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Tulp4Q9JIL5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Tulp4Q9JIL5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Tulp4Q9JIL5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Tulp4Q9JIL5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Tulp4Q9JIL5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Tulp4Q9JIL5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Tulp4Q9JIL5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Tulp4Q9JIL5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Tulp4Q9JIL5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Tulp4Q9JIL5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Tulp4Q9JIL5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Tulp4Q9JIL5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Tulp4Q9JIL5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Tulp4Q9JIL5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Tulp4Q9JIL5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Tulp4Q9JIL5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Tulp4Q9JIL5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Tulp4Q9JIL5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Tulp4Q9JIL5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Tulp4Q9JIL5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Tulp4Q9JIL5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Tulp4Q9JIL5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Tulp4Q9JIL5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Tulp4Q9JIL5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Tulp4Q9JIL5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Tulp4Q9JIL5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tulp4Q9JIL5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Tulp4Q9JIL5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Tulp4Q9JIL5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Tulp4Q9JIL5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Tulp4Q9JIL5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Tulp4Q9JIL5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tulp4Q9JIL5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tulp4Q9JIL5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tulp4Q9JIL5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tulp4Q9JIL5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tulp4Q9JIL5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Tulp4Q9JIL5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Tulp4Q9JIL5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Tulp4Q9JIL5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Tulp4Q9JIL5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Tulp4Q9JIL5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Tulp4Q9JIL5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Tulp4Q9JIL5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Tulp4Q9JIL5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Tulp4Q9JIL5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tulp4Q9JIL5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tulp4Q9JIL5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tulp4Q9JIL5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Tulp4Q9JIL5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Tulp4Q9JIL5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tulp4Q9JIL5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tulp4Q9JIL5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tulp4Q9JIL5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tulp4Q9JIL5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tulp4Q9JIL5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Tulp4Q9JIL5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Tulp4Q9JIL5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Tulp4Q9JIL5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Tulp4Q9JIL5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Tulp4Q9JIL5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Tulp4Q9JIL5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Tulp4Q9JIL5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Tulp4Q9JIL5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Tulp4Q9JIL5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Tulp4Q9JIL5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Tulp4Q9JIL5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Tulp4Q9JIL5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Tulp4Q9JIL5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Tulp4Q9JIL5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Tulp4Q9JIL5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Tulp4Q9JIL5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Tulp4Q9JIL5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Tulp4Q9JIL5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Tulp4Q9JIL5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Tulp4Q9JIL5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms