Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD87

C6orf50, Putative uncharacterized protein C6orf50, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf50Q9HD87 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
C6orf50Q9HD87 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
C6orf50Q9HD87 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
C6orf50Q9HD87 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
C6orf50Q9HD87 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
C6orf50Q9HD87 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
C6orf50Q9HD87 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
C6orf50Q9HD87 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
C6orf50Q9HD87 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C6orf50Q9HD87 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C6orf50Q9HD87 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C6orf50Q9HD87 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C6orf50Q9HD87 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C6orf50Q9HD87 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C6orf50Q9HD87 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
C6orf50Q9HD87 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C6orf50Q9HD87 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C6orf50Q9HD87 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
C6orf50Q9HD87 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C6orf50Q9HD87 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C6orf50Q9HD87 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C6orf50Q9HD87 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C6orf50Q9HD87 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C6orf50Q9HD87 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C6orf50Q9HD87 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C6orf50Q9HD87 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C6orf50Q9HD87 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C6orf50Q9HD87 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms