Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU8

POLD4, DNA polymerase delta subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD4Q9HCU8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
POLD4Q9HCU8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLD4Q9HCU8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLD4Q9HCU8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLD4Q9HCU8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLD4Q9HCU8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLD4Q9HCU8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLD4Q9HCU8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLD4Q9HCU8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLD4Q9HCU8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLD4Q9HCU8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLD4Q9HCU8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLD4Q9HCU8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLD4Q9HCU8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLD4Q9HCU8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLD4Q9HCU8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLD4Q9HCU8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLD4Q9HCU8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLD4Q9HCU8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLD4Q9HCU8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLD4Q9HCU8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLD4Q9HCU8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLD4Q9HCU8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLD4Q9HCU8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLD4Q9HCU8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLD4Q9HCU8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLD4Q9HCU8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLD4Q9HCU8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLD4Q9HCU8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLD4Q9HCU8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLD4Q9HCU8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLD4Q9HCU8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
POLD4Q9HCU8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLD4Q9HCU8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLD4Q9HCU8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLD4Q9HCU8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
POLD4Q9HCU8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLD4Q9HCU8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLD4Q9HCU8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
POLD4Q9HCU8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLD4Q9HCU8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms