Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
VAT1LQ9HCJ6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VAT1LQ9HCJ6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VAT1LQ9HCJ6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
VAT1LQ9HCJ6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VAT1LQ9HCJ6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VAT1LQ9HCJ6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VAT1LQ9HCJ6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
VAT1LQ9HCJ6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VAT1LQ9HCJ6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
VAT1LQ9HCJ6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VAT1LQ9HCJ6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VAT1LQ9HCJ6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VAT1LQ9HCJ6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VAT1LQ9HCJ6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VAT1LQ9HCJ6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VAT1LQ9HCJ6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VAT1LQ9HCJ6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VAT1LQ9HCJ6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VAT1LQ9HCJ6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
VAT1LQ9HCJ6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VAT1LQ9HCJ6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VAT1LQ9HCJ6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VAT1LQ9HCJ6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VAT1LQ9HCJ6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VAT1LQ9HCJ6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VAT1LQ9HCJ6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VAT1LQ9HCJ6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
VAT1LQ9HCJ6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VAT1LQ9HCJ6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VAT1LQ9HCJ6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VAT1LQ9HCJ6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
VAT1LQ9HCJ6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VAT1LQ9HCJ6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VAT1LQ9HCJ6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VAT1LQ9HCJ6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VAT1LQ9HCJ6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VAT1LQ9HCJ6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VAT1LQ9HCJ6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VAT1LQ9HCJ6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VAT1LQ9HCJ6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VAT1LQ9HCJ6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
VAT1LQ9HCJ6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VAT1LQ9HCJ6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VAT1LQ9HCJ6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VAT1LQ9HCJ6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VAT1LQ9HCJ6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VAT1LQ9HCJ6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VAT1LQ9HCJ6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VAT1LQ9HCJ6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VAT1LQ9HCJ6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
VAT1LQ9HCJ6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VAT1LQ9HCJ6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VAT1LQ9HCJ6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VAT1LQ9HCJ6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VAT1LQ9HCJ6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VAT1LQ9HCJ6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms