Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ELL3Q9HB65 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ELL3Q9HB65 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELL3Q9HB65 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms