Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP13A3Q9H7F0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP13A3Q9H7F0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP13A3Q9H7F0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP13A3Q9H7F0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP13A3Q9H7F0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP13A3Q9H7F0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A3Q9H7F0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A3Q9H7F0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP13A3Q9H7F0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP13A3Q9H7F0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP13A3Q9H7F0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP13A3Q9H7F0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP13A3Q9H7F0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP13A3Q9H7F0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP13A3Q9H7F0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP13A3Q9H7F0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP13A3Q9H7F0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP13A3Q9H7F0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP13A3Q9H7F0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP13A3Q9H7F0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP13A3Q9H7F0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP13A3Q9H7F0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP13A3Q9H7F0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms