Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K1

SIK2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK2Q9H0K1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIK2Q9H0K1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIK2Q9H0K1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIK2Q9H0K1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIK2Q9H0K1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIK2Q9H0K1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIK2Q9H0K1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK2Q9H0K1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIK2Q9H0K1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIK2Q9H0K1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIK2Q9H0K1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIK2Q9H0K1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIK2Q9H0K1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SIK2Q9H0K1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIK2Q9H0K1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SIK2Q9H0K1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms