Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD8

Parvg, Gamma-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvgQ9ERD8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ParvgQ9ERD8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ParvgQ9ERD8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ParvgQ9ERD8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ParvgQ9ERD8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ParvgQ9ERD8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ParvgQ9ERD8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ParvgQ9ERD8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ParvgQ9ERD8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ParvgQ9ERD8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ParvgQ9ERD8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ParvgQ9ERD8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ParvgQ9ERD8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ParvgQ9ERD8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ParvgQ9ERD8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ParvgQ9ERD8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ParvgQ9ERD8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ParvgQ9ERD8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ParvgQ9ERD8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ParvgQ9ERD8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ParvgQ9ERD8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ParvgQ9ERD8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ParvgQ9ERD8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ParvgQ9ERD8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ParvgQ9ERD8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ParvgQ9ERD8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ParvgQ9ERD8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ParvgQ9ERD8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ParvgQ9ERD8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ParvgQ9ERD8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ParvgQ9ERD8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ParvgQ9ERD8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ParvgQ9ERD8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ParvgQ9ERD8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ParvgQ9ERD8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ParvgQ9ERD8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ParvgQ9ERD8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ParvgQ9ERD8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ParvgQ9ERD8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ParvgQ9ERD8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ParvgQ9ERD8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ParvgQ9ERD8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ParvgQ9ERD8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ParvgQ9ERD8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ParvgQ9ERD8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ParvgQ9ERD8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ParvgQ9ERD8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ParvgQ9ERD8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ParvgQ9ERD8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ParvgQ9ERD8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ParvgQ9ERD8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ParvgQ9ERD8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ParvgQ9ERD8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ParvgQ9ERD8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ParvgQ9ERD8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ParvgQ9ERD8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ParvgQ9ERD8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ParvgQ9ERD8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ParvgQ9ERD8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ParvgQ9ERD8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ParvgQ9ERD8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ParvgQ9ERD8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ParvgQ9ERD8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ParvgQ9ERD8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ParvgQ9ERD8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ParvgQ9ERD8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ParvgQ9ERD8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ParvgQ9ERD8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ParvgQ9ERD8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ParvgQ9ERD8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ParvgQ9ERD8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ParvgQ9ERD8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ParvgQ9ERD8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ParvgQ9ERD8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ParvgQ9ERD8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ParvgQ9ERD8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ParvgQ9ERD8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ParvgQ9ERD8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ParvgQ9ERD8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ParvgQ9ERD8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ParvgQ9ERD8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ParvgQ9ERD8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ParvgQ9ERD8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ParvgQ9ERD8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ParvgQ9ERD8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ParvgQ9ERD8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ParvgQ9ERD8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ParvgQ9ERD8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ParvgQ9ERD8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ParvgQ9ERD8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ParvgQ9ERD8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ParvgQ9ERD8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ParvgQ9ERD8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ParvgQ9ERD8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ParvgQ9ERD8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ParvgQ9ERD8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ParvgQ9ERD8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ParvgQ9ERD8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ParvgQ9ERD8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ParvgQ9ERD8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms