Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPW9

Tlr6, Toll-like receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr6Q9EPW9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tlr6Q9EPW9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tlr6Q9EPW9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tlr6Q9EPW9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tlr6Q9EPW9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tlr6Q9EPW9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tlr6Q9EPW9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tlr6Q9EPW9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tlr6Q9EPW9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tlr6Q9EPW9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tlr6Q9EPW9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tlr6Q9EPW9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tlr6Q9EPW9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tlr6Q9EPW9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tlr6Q9EPW9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tlr6Q9EPW9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tlr6Q9EPW9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr6Q9EPW9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr6Q9EPW9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr6Q9EPW9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr6Q9EPW9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr6Q9EPW9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tlr6Q9EPW9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tlr6Q9EPW9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tlr6Q9EPW9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlr6Q9EPW9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlr6Q9EPW9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tlr6Q9EPW9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tlr6Q9EPW9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tlr6Q9EPW9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tlr6Q9EPW9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tlr6Q9EPW9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tlr6Q9EPW9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tlr6Q9EPW9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tlr6Q9EPW9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tlr6Q9EPW9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tlr6Q9EPW9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tlr6Q9EPW9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tlr6Q9EPW9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tlr6Q9EPW9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tlr6Q9EPW9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlr6Q9EPW9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlr6Q9EPW9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlr6Q9EPW9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlr6Q9EPW9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlr6Q9EPW9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tlr6Q9EPW9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tlr6Q9EPW9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tlr6Q9EPW9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tlr6Q9EPW9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tlr6Q9EPW9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tlr6Q9EPW9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tlr6Q9EPW9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tlr6Q9EPW9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tlr6Q9EPW9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tlr6Q9EPW9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tlr6Q9EPW9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tlr6Q9EPW9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tlr6Q9EPW9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tlr6Q9EPW9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tlr6Q9EPW9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tlr6Q9EPW9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tlr6Q9EPW9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tlr6Q9EPW9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tlr6Q9EPW9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tlr6Q9EPW9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlr6Q9EPW9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlr6Q9EPW9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tlr6Q9EPW9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tlr6Q9EPW9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms