Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfgap1Q9EPJ9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgap1Q9EPJ9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arfgap1Q9EPJ9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfgap1Q9EPJ9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfgap1Q9EPJ9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfgap1Q9EPJ9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfgap1Q9EPJ9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfgap1Q9EPJ9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfgap1Q9EPJ9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arfgap1Q9EPJ9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgap1Q9EPJ9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgap1Q9EPJ9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arfgap1Q9EPJ9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgap1Q9EPJ9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgap1Q9EPJ9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgap1Q9EPJ9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgap1Q9EPJ9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgap1Q9EPJ9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgap1Q9EPJ9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arfgap1Q9EPJ9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfgap1Q9EPJ9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfgap1Q9EPJ9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfgap1Q9EPJ9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfgap1Q9EPJ9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arfgap1Q9EPJ9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms