Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1M0

Sec13, Protein SEC13 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec13Q9D1M0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec13Q9D1M0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec13Q9D1M0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec13Q9D1M0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sec13Q9D1M0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec13Q9D1M0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec13Q9D1M0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec13Q9D1M0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec13Q9D1M0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec13Q9D1M0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec13Q9D1M0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec13Q9D1M0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec13Q9D1M0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec13Q9D1M0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec13Q9D1M0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec13Q9D1M0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec13Q9D1M0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec13Q9D1M0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec13Q9D1M0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec13Q9D1M0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec13Q9D1M0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec13Q9D1M0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec13Q9D1M0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec13Q9D1M0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec13Q9D1M0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec13Q9D1M0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec13Q9D1M0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec13Q9D1M0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec13Q9D1M0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec13Q9D1M0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec13Q9D1M0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec13Q9D1M0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec13Q9D1M0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec13Q9D1M0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec13Q9D1M0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec13Q9D1M0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sec13Q9D1M0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sec13Q9D1M0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sec13Q9D1M0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sec13Q9D1M0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sec13Q9D1M0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sec13Q9D1M0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec13Q9D1M0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec13Q9D1M0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec13Q9D1M0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec13Q9D1M0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec13Q9D1M0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec13Q9D1M0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec13Q9D1M0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec13Q9D1M0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec13Q9D1M0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec13Q9D1M0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec13Q9D1M0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec13Q9D1M0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec13Q9D1M0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec13Q9D1M0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec13Q9D1M0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec13Q9D1M0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sec13Q9D1M0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec13Q9D1M0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec13Q9D1M0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec13Q9D1M0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec13Q9D1M0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec13Q9D1M0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec13Q9D1M0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec13Q9D1M0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec13Q9D1M0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec13Q9D1M0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec13Q9D1M0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec13Q9D1M0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec13Q9D1M0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec13Q9D1M0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec13Q9D1M0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec13Q9D1M0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec13Q9D1M0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec13Q9D1M0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec13Q9D1M0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec13Q9D1M0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec13Q9D1M0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec13Q9D1M0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec13Q9D1M0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec13Q9D1M0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec13Q9D1M0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec13Q9D1M0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec13Q9D1M0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec13Q9D1M0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec13Q9D1M0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec13Q9D1M0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec13Q9D1M0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec13Q9D1M0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec13Q9D1M0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec13Q9D1M0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec13Q9D1M0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec13Q9D1M0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec13Q9D1M0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec13Q9D1M0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec13Q9D1M0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec13Q9D1M0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec13Q9D1M0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms