Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pin4Q9CWW6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pin4Q9CWW6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pin4Q9CWW6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pin4Q9CWW6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pin4Q9CWW6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pin4Q9CWW6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pin4Q9CWW6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pin4Q9CWW6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pin4Q9CWW6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pin4Q9CWW6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pin4Q9CWW6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pin4Q9CWW6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pin4Q9CWW6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pin4Q9CWW6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pin4Q9CWW6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pin4Q9CWW6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pin4Q9CWW6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pin4Q9CWW6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pin4Q9CWW6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pin4Q9CWW6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pin4Q9CWW6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pin4Q9CWW6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pin4Q9CWW6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pin4Q9CWW6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pin4Q9CWW6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pin4Q9CWW6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pin4Q9CWW6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pin4Q9CWW6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pin4Q9CWW6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pin4Q9CWW6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pin4Q9CWW6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pin4Q9CWW6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pin4Q9CWW6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pin4Q9CWW6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pin4Q9CWW6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pin4Q9CWW6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pin4Q9CWW6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pin4Q9CWW6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pin4Q9CWW6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pin4Q9CWW6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pin4Q9CWW6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pin4Q9CWW6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pin4Q9CWW6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pin4Q9CWW6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pin4Q9CWW6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pin4Q9CWW6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pin4Q9CWW6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pin4Q9CWW6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pin4Q9CWW6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pin4Q9CWW6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pin4Q9CWW6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pin4Q9CWW6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pin4Q9CWW6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pin4Q9CWW6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pin4Q9CWW6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pin4Q9CWW6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pin4Q9CWW6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pin4Q9CWW6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pin4Q9CWW6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pin4Q9CWW6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pin4Q9CWW6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pin4Q9CWW6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pin4Q9CWW6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pin4Q9CWW6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pin4Q9CWW6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pin4Q9CWW6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pin4Q9CWW6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pin4Q9CWW6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pin4Q9CWW6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pin4Q9CWW6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pin4Q9CWW6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pin4Q9CWW6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pin4Q9CWW6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pin4Q9CWW6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pin4Q9CWW6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pin4Q9CWW6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pin4Q9CWW6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pin4Q9CWW6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pin4Q9CWW6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pin4Q9CWW6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pin4Q9CWW6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pin4Q9CWW6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pin4Q9CWW6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pin4Q9CWW6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Pin4Q9CWW6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pin4Q9CWW6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pin4Q9CWW6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pin4Q9CWW6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pin4Q9CWW6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pin4Q9CWW6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pin4Q9CWW6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pin4Q9CWW6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pin4Q9CWW6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pin4Q9CWW6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pin4Q9CWW6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pin4Q9CWW6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pin4Q9CWW6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pin4Q9CWW6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pin4Q9CWW6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms