Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTMR12Q9C0I1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTMR12Q9C0I1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTMR12Q9C0I1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTMR12Q9C0I1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MTMR12Q9C0I1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTMR12Q9C0I1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTMR12Q9C0I1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTMR12Q9C0I1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTMR12Q9C0I1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTMR12Q9C0I1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTMR12Q9C0I1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTMR12Q9C0I1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTMR12Q9C0I1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTMR12Q9C0I1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTMR12Q9C0I1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MTMR12Q9C0I1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MTMR12Q9C0I1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTMR12Q9C0I1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTMR12Q9C0I1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR12Q9C0I1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR12Q9C0I1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR12Q9C0I1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTMR12Q9C0I1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTMR12Q9C0I1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTMR12Q9C0I1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTMR12Q9C0I1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTMR12Q9C0I1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTMR12Q9C0I1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTMR12Q9C0I1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTMR12Q9C0I1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTMR12Q9C0I1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTMR12Q9C0I1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTMR12Q9C0I1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTMR12Q9C0I1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MTMR12Q9C0I1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTMR12Q9C0I1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTMR12Q9C0I1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MTMR12Q9C0I1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTMR12Q9C0I1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTMR12Q9C0I1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MTMR12Q9C0I1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTMR12Q9C0I1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms