Protein–RNA interactions for Protein: Q91XU3

Pip4k2c, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 gamma, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4k2cQ91XU3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pip4k2cQ91XU3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pip4k2cQ91XU3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pip4k2cQ91XU3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pip4k2cQ91XU3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pip4k2cQ91XU3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pip4k2cQ91XU3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pip4k2cQ91XU3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pip4k2cQ91XU3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pip4k2cQ91XU3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pip4k2cQ91XU3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pip4k2cQ91XU3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pip4k2cQ91XU3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pip4k2cQ91XU3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pip4k2cQ91XU3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pip4k2cQ91XU3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pip4k2cQ91XU3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pip4k2cQ91XU3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pip4k2cQ91XU3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pip4k2cQ91XU3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pip4k2cQ91XU3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pip4k2cQ91XU3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pip4k2cQ91XU3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pip4k2cQ91XU3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pip4k2cQ91XU3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pip4k2cQ91XU3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pip4k2cQ91XU3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pip4k2cQ91XU3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pip4k2cQ91XU3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pip4k2cQ91XU3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pip4k2cQ91XU3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pip4k2cQ91XU3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pip4k2cQ91XU3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pip4k2cQ91XU3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pip4k2cQ91XU3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pip4k2cQ91XU3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pip4k2cQ91XU3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pip4k2cQ91XU3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pip4k2cQ91XU3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pip4k2cQ91XU3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pip4k2cQ91XU3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pip4k2cQ91XU3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pip4k2cQ91XU3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pip4k2cQ91XU3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pip4k2cQ91XU3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pip4k2cQ91XU3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pip4k2cQ91XU3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pip4k2cQ91XU3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pip4k2cQ91XU3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pip4k2cQ91XU3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pip4k2cQ91XU3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pip4k2cQ91XU3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pip4k2cQ91XU3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pip4k2cQ91XU3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pip4k2cQ91XU3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pip4k2cQ91XU3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pip4k2cQ91XU3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pip4k2cQ91XU3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pip4k2cQ91XU3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pip4k2cQ91XU3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pip4k2cQ91XU3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pip4k2cQ91XU3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pip4k2cQ91XU3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pip4k2cQ91XU3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pip4k2cQ91XU3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pip4k2cQ91XU3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pip4k2cQ91XU3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pip4k2cQ91XU3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pip4k2cQ91XU3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pip4k2cQ91XU3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pip4k2cQ91XU3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pip4k2cQ91XU3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pip4k2cQ91XU3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pip4k2cQ91XU3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms