Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMBR1Q8WVP7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LMBR1Q8WVP7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LMBR1Q8WVP7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LMBR1Q8WVP7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LMBR1Q8WVP7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMBR1Q8WVP7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMBR1Q8WVP7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LMBR1Q8WVP7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMBR1Q8WVP7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMBR1Q8WVP7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMBR1Q8WVP7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMBR1Q8WVP7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LMBR1Q8WVP7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMBR1Q8WVP7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMBR1Q8WVP7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMBR1Q8WVP7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMBR1Q8WVP7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMBR1Q8WVP7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMBR1Q8WVP7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMBR1Q8WVP7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LMBR1Q8WVP7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LMBR1Q8WVP7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LMBR1Q8WVP7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMBR1Q8WVP7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMBR1Q8WVP7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMBR1Q8WVP7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMBR1Q8WVP7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMBR1Q8WVP7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMBR1Q8WVP7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMBR1Q8WVP7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMBR1Q8WVP7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMBR1Q8WVP7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMBR1Q8WVP7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMBR1Q8WVP7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMBR1Q8WVP7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMBR1Q8WVP7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMBR1Q8WVP7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMBR1Q8WVP7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMBR1Q8WVP7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LMBR1Q8WVP7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMBR1Q8WVP7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMBR1Q8WVP7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMBR1Q8WVP7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMBR1Q8WVP7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMBR1Q8WVP7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMBR1Q8WVP7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMBR1Q8WVP7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMBR1Q8WVP7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMBR1Q8WVP7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMBR1Q8WVP7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMBR1Q8WVP7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMBR1Q8WVP7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMBR1Q8WVP7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMBR1Q8WVP7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LMBR1Q8WVP7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LMBR1Q8WVP7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBR1Q8WVP7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBR1Q8WVP7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBR1Q8WVP7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBR1Q8WVP7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMBR1Q8WVP7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMBR1Q8WVP7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBR1Q8WVP7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms