Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cdk5rap2Q8K389 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cdk5rap2Q8K389 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cdk5rap2Q8K389 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cdk5rap2Q8K389 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cdk5rap2Q8K389 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cdk5rap2Q8K389 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cdk5rap2Q8K389 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cdk5rap2Q8K389 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cdk5rap2Q8K389 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Cdk5rap2Q8K389 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Cdk5rap2Q8K389 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cdk5rap2Q8K389 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cdk5rap2Q8K389 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cdk5rap2Q8K389 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cdk5rap2Q8K389 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cdk5rap2Q8K389 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cdk5rap2Q8K389 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cdk5rap2Q8K389 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cdk5rap2Q8K389 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cdk5rap2Q8K389 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cdk5rap2Q8K389 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cdk5rap2Q8K389 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cdk5rap2Q8K389 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cdk5rap2Q8K389 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cdk5rap2Q8K389 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cdk5rap2Q8K389 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cdk5rap2Q8K389 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cdk5rap2Q8K389 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cdk5rap2Q8K389 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Cdk5rap2Q8K389 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Cdk5rap2Q8K389 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Cdk5rap2Q8K389 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Cdk5rap2Q8K389 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Cdk5rap2Q8K389 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Cdk5rap2Q8K389 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Cdk5rap2Q8K389 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Cdk5rap2Q8K389 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Cdk5rap2Q8K389 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Cdk5rap2Q8K389 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Cdk5rap2Q8K389 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Cdk5rap2Q8K389 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Cdk5rap2Q8K389 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Cdk5rap2Q8K389 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Cdk5rap2Q8K389 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cdk5rap2Q8K389 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cdk5rap2Q8K389 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cdk5rap2Q8K389 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Cdk5rap2Q8K389 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Cdk5rap2Q8K389 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Cdk5rap2Q8K389 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Cdk5rap2Q8K389 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Cdk5rap2Q8K389 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Cdk5rap2Q8K389 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Cdk5rap2Q8K389 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Cdk5rap2Q8K389 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Cdk5rap2Q8K389 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Cdk5rap2Q8K389 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Cdk5rap2Q8K389 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Cdk5rap2Q8K389 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Cdk5rap2Q8K389 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Cdk5rap2Q8K389 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Cdk5rap2Q8K389 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Cdk5rap2Q8K389 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cdk5rap2Q8K389 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cdk5rap2Q8K389 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cdk5rap2Q8K389 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Cdk5rap2Q8K389 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cdk5rap2Q8K389 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cdk5rap2Q8K389 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cdk5rap2Q8K389 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cdk5rap2Q8K389 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cdk5rap2Q8K389 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Cdk5rap2Q8K389 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Cdk5rap2Q8K389 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Cdk5rap2Q8K389 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Cdk5rap2Q8K389 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Cdk5rap2Q8K389 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Cdk5rap2Q8K389 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cdk5rap2Q8K389 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Cdk5rap2Q8K389 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Cdk5rap2Q8K389 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Cdk5rap2Q8K389 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Cdk5rap2Q8K389 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Cdk5rap2Q8K389 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cdk5rap2Q8K389 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cdk5rap2Q8K389 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cdk5rap2Q8K389 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Cdk5rap2Q8K389 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Cdk5rap2Q8K389 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cdk5rap2Q8K389 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cdk5rap2Q8K389 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cdk5rap2Q8K389 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cdk5rap2Q8K389 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cdk5rap2Q8K389 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cdk5rap2Q8K389 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cdk5rap2Q8K389 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cdk5rap2Q8K389 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Cdk5rap2Q8K389 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Cdk5rap2Q8K389 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.9 ms