Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRSK2Q8IWQ3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRSK2Q8IWQ3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRSK2Q8IWQ3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRSK2Q8IWQ3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRSK2Q8IWQ3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRSK2Q8IWQ3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRSK2Q8IWQ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRSK2Q8IWQ3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRSK2Q8IWQ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRSK2Q8IWQ3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRSK2Q8IWQ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRSK2Q8IWQ3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRSK2Q8IWQ3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRSK2Q8IWQ3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRSK2Q8IWQ3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRSK2Q8IWQ3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRSK2Q8IWQ3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRSK2Q8IWQ3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRSK2Q8IWQ3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRSK2Q8IWQ3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRSK2Q8IWQ3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRSK2Q8IWQ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRSK2Q8IWQ3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRSK2Q8IWQ3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRSK2Q8IWQ3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
BRSK2Q8IWQ3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRSK2Q8IWQ3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRSK2Q8IWQ3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRSK2Q8IWQ3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
BRSK2Q8IWQ3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRSK2Q8IWQ3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRSK2Q8IWQ3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRSK2Q8IWQ3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRSK2Q8IWQ3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRSK2Q8IWQ3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRSK2Q8IWQ3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
BRSK2Q8IWQ3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRSK2Q8IWQ3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRSK2Q8IWQ3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRSK2Q8IWQ3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRSK2Q8IWQ3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BRSK2Q8IWQ3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms