Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUR0

TRAPPC5, Trafficking protein particle complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC5Q8IUR0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC5Q8IUR0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC5Q8IUR0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC5Q8IUR0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC5Q8IUR0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC5Q8IUR0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC5Q8IUR0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC5Q8IUR0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC5Q8IUR0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC5Q8IUR0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC5Q8IUR0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC5Q8IUR0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC5Q8IUR0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC5Q8IUR0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC5Q8IUR0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms