Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSF5

Klhl38, Kelch-like protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl38Q8BSF5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl38Q8BSF5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl38Q8BSF5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl38Q8BSF5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl38Q8BSF5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Klhl38Q8BSF5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl38Q8BSF5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl38Q8BSF5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl38Q8BSF5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl38Q8BSF5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl38Q8BSF5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl38Q8BSF5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl38Q8BSF5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl38Q8BSF5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl38Q8BSF5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl38Q8BSF5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl38Q8BSF5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl38Q8BSF5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl38Q8BSF5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl38Q8BSF5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl38Q8BSF5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl38Q8BSF5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl38Q8BSF5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl38Q8BSF5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl38Q8BSF5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhl38Q8BSF5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl38Q8BSF5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl38Q8BSF5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl38Q8BSF5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl38Q8BSF5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl38Q8BSF5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl38Q8BSF5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl38Q8BSF5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl38Q8BSF5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl38Q8BSF5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl38Q8BSF5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl38Q8BSF5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl38Q8BSF5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl38Q8BSF5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms