Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Susd4Q8BH32 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Susd4Q8BH32 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Susd4Q8BH32 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Susd4Q8BH32 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Susd4Q8BH32 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Susd4Q8BH32 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Susd4Q8BH32 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Susd4Q8BH32 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Susd4Q8BH32 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Susd4Q8BH32 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Susd4Q8BH32 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Susd4Q8BH32 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Susd4Q8BH32 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Susd4Q8BH32 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Susd4Q8BH32 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Susd4Q8BH32 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Susd4Q8BH32 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Susd4Q8BH32 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Susd4Q8BH32 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Susd4Q8BH32 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Susd4Q8BH32 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Susd4Q8BH32 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Susd4Q8BH32 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Susd4Q8BH32 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Susd4Q8BH32 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Susd4Q8BH32 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Susd4Q8BH32 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Susd4Q8BH32 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Susd4Q8BH32 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Susd4Q8BH32 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Susd4Q8BH32 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Susd4Q8BH32 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Susd4Q8BH32 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Susd4Q8BH32 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Susd4Q8BH32 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Susd4Q8BH32 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Susd4Q8BH32 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Susd4Q8BH32 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Susd4Q8BH32 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Susd4Q8BH32 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Susd4Q8BH32 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Susd4Q8BH32 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Susd4Q8BH32 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Susd4Q8BH32 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Susd4Q8BH32 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Susd4Q8BH32 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Susd4Q8BH32 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Susd4Q8BH32 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Susd4Q8BH32 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Susd4Q8BH32 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Susd4Q8BH32 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Susd4Q8BH32 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Susd4Q8BH32 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Susd4Q8BH32 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Susd4Q8BH32 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Susd4Q8BH32 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Susd4Q8BH32 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Susd4Q8BH32 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Susd4Q8BH32 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Susd4Q8BH32 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Susd4Q8BH32 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Susd4Q8BH32 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Susd4Q8BH32 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Susd4Q8BH32 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Susd4Q8BH32 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Susd4Q8BH32 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Susd4Q8BH32 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Susd4Q8BH32 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Susd4Q8BH32 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Susd4Q8BH32 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Susd4Q8BH32 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Susd4Q8BH32 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Susd4Q8BH32 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Susd4Q8BH32 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Susd4Q8BH32 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Susd4Q8BH32 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Susd4Q8BH32 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Susd4Q8BH32 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Susd4Q8BH32 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Susd4Q8BH32 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Susd4Q8BH32 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Susd4Q8BH32 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Susd4Q8BH32 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Susd4Q8BH32 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Susd4Q8BH32 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Susd4Q8BH32 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Susd4Q8BH32 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Susd4Q8BH32 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Susd4Q8BH32 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Susd4Q8BH32 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Susd4Q8BH32 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Susd4Q8BH32 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Susd4Q8BH32 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Susd4Q8BH32 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Susd4Q8BH32 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Susd4Q8BH32 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Susd4Q8BH32 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Susd4Q8BH32 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Susd4Q8BH32 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms