Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W0

Senp6, Sentrin-specific protease 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp6Q6P7W0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Senp6Q6P7W0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Senp6Q6P7W0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Senp6Q6P7W0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Senp6Q6P7W0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Senp6Q6P7W0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Senp6Q6P7W0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Senp6Q6P7W0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Senp6Q6P7W0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Senp6Q6P7W0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Senp6Q6P7W0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Senp6Q6P7W0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Senp6Q6P7W0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Senp6Q6P7W0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Senp6Q6P7W0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Senp6Q6P7W0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Senp6Q6P7W0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Senp6Q6P7W0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Senp6Q6P7W0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Senp6Q6P7W0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Senp6Q6P7W0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Senp6Q6P7W0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Senp6Q6P7W0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Senp6Q6P7W0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Senp6Q6P7W0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Senp6Q6P7W0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Senp6Q6P7W0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Senp6Q6P7W0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms