Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W0

Senp6, Sentrin-specific protease 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp6Q6P7W0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Senp6Q6P7W0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Senp6Q6P7W0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Senp6Q6P7W0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Senp6Q6P7W0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Senp6Q6P7W0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Senp6Q6P7W0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Senp6Q6P7W0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Senp6Q6P7W0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Senp6Q6P7W0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Senp6Q6P7W0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Senp6Q6P7W0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Senp6Q6P7W0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Senp6Q6P7W0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Senp6Q6P7W0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Senp6Q6P7W0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Senp6Q6P7W0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Senp6Q6P7W0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Senp6Q6P7W0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Senp6Q6P7W0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Senp6Q6P7W0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Senp6Q6P7W0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Senp6Q6P7W0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Senp6Q6P7W0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Senp6Q6P7W0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Senp6Q6P7W0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Senp6Q6P7W0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Senp6Q6P7W0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Senp6Q6P7W0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Senp6Q6P7W0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Senp6Q6P7W0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Senp6Q6P7W0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms