Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM164Q5U3C3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM164Q5U3C3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM164Q5U3C3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM164Q5U3C3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms