Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDN3

Gm45902, Predicted gene 45902, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45902Q3UDN3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm45902Q3UDN3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm45902Q3UDN3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm45902Q3UDN3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm45902Q3UDN3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm45902Q3UDN3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm45902Q3UDN3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm45902Q3UDN3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm45902Q3UDN3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm45902Q3UDN3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm45902Q3UDN3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm45902Q3UDN3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm45902Q3UDN3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm45902Q3UDN3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm45902Q3UDN3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm45902Q3UDN3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm45902Q3UDN3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm45902Q3UDN3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm45902Q3UDN3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm45902Q3UDN3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm45902Q3UDN3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm45902Q3UDN3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm45902Q3UDN3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm45902Q3UDN3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms