Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Ccdc136Q3TVA9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Ccdc136Q3TVA9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Ccdc136Q3TVA9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Ccdc136Q3TVA9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Ccdc136Q3TVA9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Ccdc136Q3TVA9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Ccdc136Q3TVA9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Ccdc136Q3TVA9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Ccdc136Q3TVA9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
Ccdc136Q3TVA9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Ccdc136Q3TVA9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Ccdc136Q3TVA9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Ccdc136Q3TVA9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Ccdc136Q3TVA9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Ccdc136Q3TVA9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
Ccdc136Q3TVA9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
Ccdc136Q3TVA9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Ccdc136Q3TVA9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Ccdc136Q3TVA9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Ccdc136Q3TVA9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Ccdc136Q3TVA9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Ccdc136Q3TVA9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Ccdc136Q3TVA9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Ccdc136Q3TVA9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Ccdc136Q3TVA9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Ccdc136Q3TVA9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Ccdc136Q3TVA9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Ccdc136Q3TVA9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Ccdc136Q3TVA9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Ccdc136Q3TVA9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Ccdc136Q3TVA9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Ccdc136Q3TVA9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Ccdc136Q3TVA9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Ccdc136Q3TVA9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Ccdc136Q3TVA9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
Ccdc136Q3TVA9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
Ccdc136Q3TVA9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Ccdc136Q3TVA9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Ccdc136Q3TVA9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Ccdc136Q3TVA9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Ccdc136Q3TVA9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Ccdc136Q3TVA9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Ccdc136Q3TVA9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Ccdc136Q3TVA9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Ccdc136Q3TVA9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
Ccdc136Q3TVA9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
Ccdc136Q3TVA9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Ccdc136Q3TVA9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Ccdc136Q3TVA9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Ccdc136Q3TVA9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Ccdc136Q3TVA9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
Ccdc136Q3TVA9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Ccdc136Q3TVA9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Ccdc136Q3TVA9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Ccdc136Q3TVA9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Ccdc136Q3TVA9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
Ccdc136Q3TVA9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
Ccdc136Q3TVA9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Ccdc136Q3TVA9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Ccdc136Q3TVA9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Ccdc136Q3TVA9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Ccdc136Q3TVA9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Ccdc136Q3TVA9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Ccdc136Q3TVA9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Ccdc136Q3TVA9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Ccdc136Q3TVA9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
Ccdc136Q3TVA9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Ccdc136Q3TVA9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
Ccdc136Q3TVA9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Ccdc136Q3TVA9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
Ccdc136Q3TVA9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Ccdc136Q3TVA9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Ccdc136Q3TVA9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
Ccdc136Q3TVA9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC40.04■■■■■ 4
Ccdc136Q3TVA9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
Ccdc136Q3TVA9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Ccdc136Q3TVA9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Ccdc136Q3TVA9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
Ccdc136Q3TVA9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Ccdc136Q3TVA9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Ccdc136Q3TVA9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC40■■■■□ 3.99
Ccdc136Q3TVA9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Ccdc136Q3TVA9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Ccdc136Q3TVA9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Ccdc136Q3TVA9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Ccdc136Q3TVA9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Ccdc136Q3TVA9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Ccdc136Q3TVA9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Ccdc136Q3TVA9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Ccdc136Q3TVA9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Ccdc136Q3TVA9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Ccdc136Q3TVA9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Ccdc136Q3TVA9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Ccdc136Q3TVA9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Ccdc136Q3TVA9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Ccdc136Q3TVA9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Ccdc136Q3TVA9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms