Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEC23AQ15436 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEC23AQ15436 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEC23AQ15436 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEC23AQ15436 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEC23AQ15436 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEC23AQ15436 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEC23AQ15436 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEC23AQ15436 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEC23AQ15436 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEC23AQ15436 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEC23AQ15436 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEC23AQ15436 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEC23AQ15436 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEC23AQ15436 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEC23AQ15436 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SEC23AQ15436 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SEC23AQ15436 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SEC23AQ15436 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SEC23AQ15436 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEC23AQ15436 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEC23AQ15436 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEC23AQ15436 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEC23AQ15436 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEC23AQ15436 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEC23AQ15436 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEC23AQ15436 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEC23AQ15436 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEC23AQ15436 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEC23AQ15436 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEC23AQ15436 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEC23AQ15436 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEC23AQ15436 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEC23AQ15436 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEC23AQ15436 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEC23AQ15436 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEC23AQ15436 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SEC23AQ15436 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SEC23AQ15436 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SEC23AQ15436 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SEC23AQ15436 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEC23AQ15436 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEC23AQ15436 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEC23AQ15436 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEC23AQ15436 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SEC23AQ15436 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEC23AQ15436 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEC23AQ15436 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEC23AQ15436 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEC23AQ15436 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEC23AQ15436 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEC23AQ15436 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SEC23AQ15436 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SEC23AQ15436 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SEC23AQ15436 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SEC23AQ15436 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SEC23AQ15436 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SEC23AQ15436 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SEC23AQ15436 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SEC23AQ15436 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SEC23AQ15436 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SEC23AQ15436 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SEC23AQ15436 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEC23AQ15436 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEC23AQ15436 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEC23AQ15436 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SEC23AQ15436 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SEC23AQ15436 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SEC23AQ15436 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SEC23AQ15436 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SEC23AQ15436 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SEC23AQ15436 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC23AQ15436 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC23AQ15436 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC23AQ15436 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC23AQ15436 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC23AQ15436 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC23AQ15436 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SEC23AQ15436 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SEC23AQ15436 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SEC23AQ15436 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SEC23AQ15436 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SEC23AQ15436 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SEC23AQ15436 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SEC23AQ15436 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SEC23AQ15436 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SEC23AQ15436 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SEC23AQ15436 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SEC23AQ15436 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SEC23AQ15436 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SEC23AQ15436 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SEC23AQ15436 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SEC23AQ15436 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEC23AQ15436 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEC23AQ15436 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEC23AQ15436 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEC23AQ15436 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEC23AQ15436 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SEC23AQ15436 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEC23AQ15436 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
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