Protein–RNA interactions for Protein: Q12255

NYV1, Vacuolar v-SNARE NYV1, yeastyeast

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NYV1Q12255 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.54□□□□□ -1.04
NYV1Q12255 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.54□□□□□ -1.04
NYV1Q12255 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.54□□□□□ -1.04
NYV1Q12255 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.54□□□□□ -1.04
NYV1Q12255 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.54□□□□□ -1.04
NYV1Q12255 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.54□□□□□ -1.04
NYV1Q12255 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.54□□□□□ -1.04
NYV1Q12255 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.54□□□□□ -1.04
NYV1Q12255 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.54□□□□□ -1.04
NYV1Q12255 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt8.54□□□□□ -1.04
NYV1Q12255 MED6YHR058C 888 nt8.54□□□□□ -1.04
NYV1Q12255 YLR463CYLR463C 552 nt8.54□□□□□ -1.04
NYV1Q12255 MRPS18YNL306W 654 nt8.54□□□□□ -1.04
NYV1Q12255 LEO1YOR123C 1395 nt8.53□□□□□ -1.04
NYV1Q12255 TAF9YMR236W 474 nt8.53□□□□□ -1.04
NYV1Q12255 YOR200WYOR200W 399 nt8.53□□□□□ -1.04
NYV1Q12255 ADE5,7YGL234W 2409 nt8.53□□□□□ -1.04
NYV1Q12255 YIP4YGL198W 708 nt8.51□□□□□ -1.05
NYV1Q12255 YAH1YPL252C 519 nt8.51□□□□□ -1.05
NYV1Q12255 ASF1YJL115W 840 nt8.5□□□□□ -1.05
NYV1Q12255 NSG2YNL156C 900 nt8.5□□□□□ -1.05
NYV1Q12255 YOL099CYOL099C 492 nt8.5□□□□□ -1.05
NYV1Q12255 OSW2YLR054C 2175 nt8.49□□□□□ -1.05
NYV1Q12255 COG1YGL223C 1254 nt8.49□□□□□ -1.05
NYV1Q12255 NUP49YGL172W 1419 nt8.48□□□□□ -1.05
NYV1Q12255 IDP3YNL009W 1263 nt8.48□□□□□ -1.05
NYV1Q12255 SNU66YOR308C 1764 nt8.48□□□□□ -1.05
NYV1Q12255 RRP9YPR137W 1722 nt8.47□□□□□ -1.05
NYV1Q12255 GCG1YER163C 699 nt8.47□□□□□ -1.05
NYV1Q12255 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt8.47□□□□□ -1.05
NYV1Q12255 NTG2YOL043C 1143 nt8.47□□□□□ -1.05
NYV1Q12255 ERG24YNL280C 1317 nt8.47□□□□□ -1.05
NYV1Q12255 AFG3YER017C 2286 nt8.46□□□□□ -1.05
NYV1Q12255 SUF3tG(CCC)D 72 nt8.46□□□□□ -1.06
NYV1Q12255 RDR1YOR380W 1641 nt8.46□□□□□ -1.06
NYV1Q12255 FMO1YHR176W 1299 nt8.45□□□□□ -1.06
NYV1Q12255 FAF1YIL019W 1041 nt8.45□□□□□ -1.06
NYV1Q12255 SNA3YJL151C 402 nt8.45□□□□□ -1.06
NYV1Q12255 YLL058WYLL058W 1728 nt8.45□□□□□ -1.06
NYV1Q12255 SNF7YLR025W 723 nt8.44□□□□□ -1.06
NYV1Q12255 YKR023WYKR023W 1593 nt8.44□□□□□ -1.06
NYV1Q12255 URA8YJR103W 1737 nt8.43□□□□□ -1.06
NYV1Q12255 YML018CYML018C 1182 nt8.43□□□□□ -1.06
NYV1Q12255 CDC1YDR182W 1476 nt8.43□□□□□ -1.06
NYV1Q12255 ATG22YCL038C 1587 nt8.43□□□□□ -1.06
NYV1Q12255 PDC5YLR134W 1692 nt8.43□□□□□ -1.06
NYV1Q12255 ERG27YLR100W 1044 nt8.42□□□□□ -1.06
NYV1Q12255 FSF1YOR271C 984 nt8.42□□□□□ -1.06
NYV1Q12255 YLR173WYLR173W 1827 nt8.42□□□□□ -1.06
NYV1Q12255 ICP55YER078C 1536 nt8.41□□□□□ -1.06
NYV1Q12255 YLL056CYLL056C 897 nt8.41□□□□□ -1.06
NYV1Q12255 YNL092WYNL092W 1203 nt8.41□□□□□ -1.06
NYV1Q12255 YBR113WYBR113W 483 nt8.41□□□□□ -1.06
NYV1Q12255 MSC3YLR219W 2187 nt8.41□□□□□ -1.06
NYV1Q12255 YJL045WYJL045W 1905 nt8.41□□□□□ -1.06
NYV1Q12255 KDX1YKL161C 1302 nt8.4□□□□□ -1.06
NYV1Q12255 YCR049CYCR049C 447 nt8.4□□□□□ -1.06
NYV1Q12255 YGL102CYGL102C 429 nt8.4□□□□□ -1.06
NYV1Q12255 MIM1YOL026C 342 nt8.4□□□□□ -1.06
NYV1Q12255 ECM27YJR106W 2178 nt8.39□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 COQ3YOL096C 939 nt8.39□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 HNM1YGL077C 1692 nt8.39□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 HDA1YNL021W 2121 nt8.38□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 PGI1YBR196C 1665 nt8.38□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 TFG2YGR005C 1203 nt8.38□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 RNH201YNL072W 924 nt8.38□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 CDC7YDL017W 1524 nt8.38□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 HBS1YKR084C 1836 nt8.38□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 ERG8YMR220W 1356 nt8.37□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 snR4snR4 186 nt8.37□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 YDR187CYDR187C 519 nt8.36□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 YDR327WYDR327W 327 nt8.36□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 TDH2YJR009C 999 nt8.36□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 YKL102CYKL102C 306 nt8.36□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 YMR122CYMR122C 375 nt8.36□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 RPL43AYPR043W 279 nt8.36□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 RTC2YBR147W 891 nt8.36□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 ADE2YOR128C 1716 nt8.36□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 MAM3YOL060C 2121 nt8.35□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 FPR3YML074C 1236 nt8.35□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 DUR3YHL016C 2208 nt8.35□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 DIA4YHR011W 1341 nt8.34□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 TPI1YDR050C 747 nt8.34□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 HIS1YER055C 894 nt8.34□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 OM45YIL136W 1182 nt8.34□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 TSR2YLR435W 618 nt8.34□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 YIL177CYIL177C 5277 nt8.34□□□□□ -1.07
NYV1Q12255 ERR1YOR393W 1314 nt8.33□□□□□ -1.08
NYV1Q12255 ERR2YPL281C 1314 nt8.33□□□□□ -1.08
NYV1Q12255 YBL113CYBL113C 2379 nt8.33□□□□□ -1.08
NYV1Q12255 PRI1YIR008C 1230 nt8.32□□□□□ -1.08
NYV1Q12255 YAL045CYAL045C 309 nt8.32□□□□□ -1.08
NYV1Q12255 YTH1YPR107C 627 nt8.32□□□□□ -1.08
NYV1Q12255 TAE1YBR261C 699 nt8.32□□□□□ -1.08
NYV1Q12255 RSC9YML127W 1746 nt8.32□□□□□ -1.08
NYV1Q12255 RUP1YOR138C 2016 nt8.31□□□□□ -1.08
NYV1Q12255 PRE3YJL001W 648 nt8.31□□□□□ -1.08
NYV1Q12255 YBR027CYBR027C 333 nt8.3□□□□□ -1.08
NYV1Q12255 SMX3YPR182W 261 nt8.3□□□□□ -1.08
NYV1Q12255 YMR295CYMR295C 594 nt8.29□□□□□ -1.08
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