Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY3A-GQ12173 PET10YKR046C 852 nt7.85□□□□□ -1.15
TY3A-GQ12173 HSV2YGR223C 1347 nt7.84□□□□□ -1.15
TY3A-GQ12173 SAL1YNL083W 1485 nt7.84□□□□□ -1.15
TY3A-GQ12173 PET117YER058W 324 nt7.84□□□□□ -1.15
TY3A-GQ12173 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt7.84□□□□□ -1.15
TY3A-GQ12173 TAF9YMR236W 474 nt7.84□□□□□ -1.15
TY3A-GQ12173 YBL112CYBL112C 318 nt7.84□□□□□ -1.15
TY3A-GQ12173 YIP4YGL198W 708 nt7.83□□□□□ -1.16
TY3A-GQ12173 Q0010Q0010 387 nt7.83□□□□□ -1.16
TY3A-GQ12173 APE4YHR113W 1473 nt7.82□□□□□ -1.16
TY3A-GQ12173 YDR215CYDR215C 414 nt7.82□□□□□ -1.16
TY3A-GQ12173 YNR005CYNR005C 405 nt7.82□□□□□ -1.16
TY3A-GQ12173 MAM3YOL060C 2121 nt7.81□□□□□ -1.16
TY3A-GQ12173 ASF1YJL115W 840 nt7.81□□□□□ -1.16
TY3A-GQ12173 ERV25YML012W 636 nt7.81□□□□□ -1.16
TY3A-GQ12173 YEL023CYEL023C 2049 nt7.81□□□□□ -1.16
TY3A-GQ12173 ALR1YOL130W 2580 nt7.8□□□□□ -1.16
TY3A-GQ12173 CRH1YGR189C 1524 nt7.8□□□□□ -1.16
TY3A-GQ12173 MDH2YOL126C 1134 nt7.8□□□□□ -1.16
TY3A-GQ12173 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.8□□□□□ -1.16
TY3A-GQ12173 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.8□□□□□ -1.16
TY3A-GQ12173 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.8□□□□□ -1.16
TY3A-GQ12173 GPD2YOL059W 1323 nt7.79□□□□□ -1.16
TY3A-GQ12173 TFG2YGR005C 1203 nt7.79□□□□□ -1.16
TY3A-GQ12173 MET30YIL046W 1923 nt7.79□□□□□ -1.16
TY3A-GQ12173 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt7.78□□□□□ -1.16
TY3A-GQ12173 IRC7YFR055W 1023 nt7.78□□□□□ -1.16
TY3A-GQ12173 CAR2YLR438W 1275 nt7.78□□□□□ -1.16
TY3A-GQ12173 YLR463CYLR463C 552 nt7.78□□□□□ -1.16
TY3A-GQ12173 YNL190WYNL190W 615 nt7.78□□□□□ -1.16
TY3A-GQ12173 GCG1YER163C 699 nt7.77□□□□□ -1.17
TY3A-GQ12173 MED6YHR058C 888 nt7.77□□□□□ -1.17
TY3A-GQ12173 YMR252CYMR252C 405 nt7.77□□□□□ -1.17
TY3A-GQ12173 FSF1YOR271C 984 nt7.77□□□□□ -1.17
TY3A-GQ12173 RRP9YPR137W 1722 nt7.76□□□□□ -1.17
TY3A-GQ12173 RNH201YNL072W 924 nt7.76□□□□□ -1.17
TY3A-GQ12173 BRN1YBL097W 2265 nt7.76□□□□□ -1.17
TY3A-GQ12173 FMO1YHR176W 1299 nt7.75□□□□□ -1.17
TY3A-GQ12173 OSW2YLR054C 2175 nt7.75□□□□□ -1.17
TY3A-GQ12173 YJL045WYJL045W 1905 nt7.74□□□□□ -1.17
TY3A-GQ12173 LSC1YOR142W 990 nt7.74□□□□□ -1.17
TY3A-GQ12173 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.74□□□□□ -1.17
TY3A-GQ12173 AIM34YMR003W 597 nt7.73□□□□□ -1.17
TY3A-GQ12173 YNL092WYNL092W 1203 nt7.73□□□□□ -1.17
TY3A-GQ12173 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt7.72□□□□□ -1.17
TY3A-GQ12173 YOL099CYOL099C 492 nt7.72□□□□□ -1.17
TY3A-GQ12173 YOR200WYOR200W 399 nt7.72□□□□□ -1.17
TY3A-GQ12173 ERG24YNL280C 1317 nt7.72□□□□□ -1.17
TY3A-GQ12173 COQ3YOL096C 939 nt7.71□□□□□ -1.18
TY3A-GQ12173 LAS17YOR181W 1902 nt7.71□□□□□ -1.18
TY3A-GQ12173 ECM27YJR106W 2178 nt7.71□□□□□ -1.18
TY3A-GQ12173 PMT7YDR307W 1989 nt7.7□□□□□ -1.18
TY3A-GQ12173 YMR122CYMR122C 375 nt7.7□□□□□ -1.18
TY3A-GQ12173 TOP3YLR234W 1971 nt7.69□□□□□ -1.18
TY3A-GQ12173 NUP49YGL172W 1419 nt7.69□□□□□ -1.18
TY3A-GQ12173 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.68□□□□□ -1.18
TY3A-GQ12173 TDH2YJR009C 999 nt7.68□□□□□ -1.18
TY3A-GQ12173 YLL056CYLL056C 897 nt7.68□□□□□ -1.18
TY3A-GQ12173 YAH1YPL252C 519 nt7.68□□□□□ -1.18
TY3A-GQ12173 ECM10YEL030W 1935 nt7.68□□□□□ -1.18
TY3A-GQ12173 CKB1YGL019W 837 nt7.67□□□□□ -1.18
TY3A-GQ12173 SNF7YLR025W 723 nt7.67□□□□□ -1.18
TY3A-GQ12173 CDC1YDR182W 1476 nt7.67□□□□□ -1.18
TY3A-GQ12173 AVL9YLR114C 2295 nt7.67□□□□□ -1.18
TY3A-GQ12173 OM45YIL136W 1182 nt7.66□□□□□ -1.18
TY3A-GQ12173 YML018CYML018C 1182 nt7.66□□□□□ -1.18
TY3A-GQ12173 NTG2YOL043C 1143 nt7.66□□□□□ -1.18
TY3A-GQ12173 ITR1YDR497C 1755 nt7.66□□□□□ -1.18
TY3A-GQ12173 YHR131CYHR131C 2553 nt7.65□□□□□ -1.18
TY3A-GQ12173 HIS1YER055C 894 nt7.65□□□□□ -1.18
TY3A-GQ12173 TPO1YLL028W 1761 nt7.65□□□□□ -1.18
TY3A-GQ12173 PRC1YMR297W 1599 nt7.65□□□□□ -1.18
TY3A-GQ12173 ERG8YMR220W 1356 nt7.64□□□□□ -1.19
TY3A-GQ12173 CHA1YCL064C 1083 nt7.64□□□□□ -1.19
TY3A-GQ12173 YCR049CYCR049C 447 nt7.64□□□□□ -1.19
TY3A-GQ12173 VPS65YLR322W 315 nt7.64□□□□□ -1.19
TY3A-GQ12173 RCF2YNR018W 675 nt7.63□□□□□ -1.19
TY3A-GQ12173 STF1YDL130W-A 261 nt7.62□□□□□ -1.19
TY3A-GQ12173 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt7.62□□□□□ -1.19
TY3A-GQ12173 YPL264CYPL264C 1062 nt7.62□□□□□ -1.19
TY3A-GQ12173 RPL43AYPR043W 279 nt7.62□□□□□ -1.19
TY3A-GQ12173 YBR113WYBR113W 483 nt7.62□□□□□ -1.19
TY3A-GQ12173 RTC2YBR147W 891 nt7.62□□□□□ -1.19
TY3A-GQ12173 LEO1YOR123C 1395 nt7.61□□□□□ -1.19
TY3A-GQ12173 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.61□□□□□ -1.19
TY3A-GQ12173 DMC1YER179W 1005 nt7.61□□□□□ -1.19
TY3A-GQ12173 PRE3YJL001W 648 nt7.61□□□□□ -1.19
TY3A-GQ12173 FPR3YML074C 1236 nt7.61□□□□□ -1.19
TY3A-GQ12173 GUT1YHL032C 2130 nt7.61□□□□□ -1.19
TY3A-GQ12173 YGL102CYGL102C 429 nt7.6□□□□□ -1.19
TY3A-GQ12173 SPE4YLR146C 903 nt7.6□□□□□ -1.19
TY3A-GQ12173 BEM1YBR200W 1656 nt7.6□□□□□ -1.19
TY3A-GQ12173 YDR327WYDR327W 327 nt7.59□□□□□ -1.19
TY3A-GQ12173 ATP10YLR393W 840 nt7.58□□□□□ -1.2
TY3A-GQ12173 SCS7YMR272C 1155 nt7.58□□□□□ -1.2
TY3A-GQ12173 ICP55YER078C 1536 nt7.57□□□□□ -1.2
TY3A-GQ12173 PEX3YDR329C 1326 nt7.57□□□□□ -1.2
TY3A-GQ12173 YDR187CYDR187C 519 nt7.57□□□□□ -1.2
TY3A-GQ12173 YMR295CYMR295C 594 nt7.57□□□□□ -1.2
TY3A-GQ12173 YBR027CYBR027C 333 nt7.57□□□□□ -1.2
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