Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPIRE1Q08AE8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPIRE1Q08AE8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPIRE1Q08AE8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPIRE1Q08AE8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPIRE1Q08AE8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPIRE1Q08AE8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPIRE1Q08AE8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPIRE1Q08AE8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPIRE1Q08AE8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPIRE1Q08AE8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPIRE1Q08AE8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPIRE1Q08AE8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPIRE1Q08AE8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPIRE1Q08AE8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPIRE1Q08AE8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPIRE1Q08AE8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SPIRE1Q08AE8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPIRE1Q08AE8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPIRE1Q08AE8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPIRE1Q08AE8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPIRE1Q08AE8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPIRE1Q08AE8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPIRE1Q08AE8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPIRE1Q08AE8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPIRE1Q08AE8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPIRE1Q08AE8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPIRE1Q08AE8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPIRE1Q08AE8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPIRE1Q08AE8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPIRE1Q08AE8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPIRE1Q08AE8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPIRE1Q08AE8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPIRE1Q08AE8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPIRE1Q08AE8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPIRE1Q08AE8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPIRE1Q08AE8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPIRE1Q08AE8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPIRE1Q08AE8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPIRE1Q08AE8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPIRE1Q08AE8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPIRE1Q08AE8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPIRE1Q08AE8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPIRE1Q08AE8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPIRE1Q08AE8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPIRE1Q08AE8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPIRE1Q08AE8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPIRE1Q08AE8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPIRE1Q08AE8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPIRE1Q08AE8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPIRE1Q08AE8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPIRE1Q08AE8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPIRE1Q08AE8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPIRE1Q08AE8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPIRE1Q08AE8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPIRE1Q08AE8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPIRE1Q08AE8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPIRE1Q08AE8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPIRE1Q08AE8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPIRE1Q08AE8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPIRE1Q08AE8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPIRE1Q08AE8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPIRE1Q08AE8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPIRE1Q08AE8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SPIRE1Q08AE8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPIRE1Q08AE8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPIRE1Q08AE8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPIRE1Q08AE8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPIRE1Q08AE8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPIRE1Q08AE8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SPIRE1Q08AE8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPIRE1Q08AE8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SPIRE1Q08AE8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPIRE1Q08AE8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPIRE1Q08AE8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SPIRE1Q08AE8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPIRE1Q08AE8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPIRE1Q08AE8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPIRE1Q08AE8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPIRE1Q08AE8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SPIRE1Q08AE8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPIRE1Q08AE8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPIRE1Q08AE8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPIRE1Q08AE8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SPIRE1Q08AE8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPIRE1Q08AE8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SPIRE1Q08AE8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPIRE1Q08AE8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SPIRE1Q08AE8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPIRE1Q08AE8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPIRE1Q08AE8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPIRE1Q08AE8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPIRE1Q08AE8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPIRE1Q08AE8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPIRE1Q08AE8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPIRE1Q08AE8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SPIRE1Q08AE8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SPIRE1Q08AE8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPIRE1Q08AE8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPIRE1Q08AE8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms