Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CkbQ04447 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CkbQ04447 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CkbQ04447 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CkbQ04447 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CkbQ04447 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CkbQ04447 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CkbQ04447 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CkbQ04447 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CkbQ04447 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CkbQ04447 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CkbQ04447 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CkbQ04447 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CkbQ04447 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CkbQ04447 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CkbQ04447 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CkbQ04447 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CkbQ04447 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CkbQ04447 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CkbQ04447 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CkbQ04447 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CkbQ04447 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CkbQ04447 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CkbQ04447 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CkbQ04447 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CkbQ04447 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CkbQ04447 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CkbQ04447 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CkbQ04447 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CkbQ04447 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CkbQ04447 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CkbQ04447 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CkbQ04447 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CkbQ04447 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CkbQ04447 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CkbQ04447 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CkbQ04447 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CkbQ04447 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CkbQ04447 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CkbQ04447 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CkbQ04447 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CkbQ04447 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CkbQ04447 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CkbQ04447 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CkbQ04447 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CkbQ04447 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CkbQ04447 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CkbQ04447 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CkbQ04447 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CkbQ04447 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CkbQ04447 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CkbQ04447 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CkbQ04447 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CkbQ04447 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CkbQ04447 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CkbQ04447 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CkbQ04447 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CkbQ04447 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CkbQ04447 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CkbQ04447 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CkbQ04447 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CkbQ04447 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CkbQ04447 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CkbQ04447 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CkbQ04447 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CkbQ04447 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CkbQ04447 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CkbQ04447 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CkbQ04447 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CkbQ04447 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CkbQ04447 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CkbQ04447 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CkbQ04447 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CkbQ04447 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CkbQ04447 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CkbQ04447 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CkbQ04447 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CkbQ04447 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CkbQ04447 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CkbQ04447 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CkbQ04447 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CkbQ04447 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CkbQ04447 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CkbQ04447 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CkbQ04447 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CkbQ04447 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CkbQ04447 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CkbQ04447 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CkbQ04447 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CkbQ04447 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CkbQ04447 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CkbQ04447 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CkbQ04447 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CkbQ04447 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CkbQ04447 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CkbQ04447 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CkbQ04447 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CkbQ04447 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CkbQ04447 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CkbQ04447 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms