Protein–RNA interactions for Protein: Q04006

UPS3, Protein UPS3, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPS3Q04006 INP54YOL065C 1155 nt5.72□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 ATP2YJR121W 1536 nt5.72□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 PHO3YBR092C 1404 nt5.72□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 YBR241CYBR241C 1467 nt5.71□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 ACS1YAL054C 2142 nt5.71□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 LIP5YOR196C 1245 nt5.71□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 YGL260WYGL260W 231 nt5.7□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 OPI1YHL020C 1215 nt5.7□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 YML034C-AYML034C-A 399 nt5.7□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 SUR7YML052W 909 nt5.7□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 STE3YKL178C 1413 nt5.7□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 YIL055CYIL055C 1884 nt5.7□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 ISC1YER019W 1434 nt5.69□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 MCH2YKL221W 1422 nt5.69□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 HSP12YFL014W 330 nt5.69□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 RPL2BYIL018W 765 nt5.69□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 OPI11YPR044C 354 nt5.69□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 HXK2YGL253W 1461 nt5.69□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 YGR127WYGR127W 939 nt5.68□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 SEN2YLR105C 1134 nt5.68□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 RCR1YBR005W 642 nt5.68□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 YPT10YBR264C 600 nt5.68□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 RIO1YOR119C 1455 nt5.68□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 EXG2YDR261C 1689 nt5.68□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 snR82snR82 268 nt5.67□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 YJL064WYJL064W 396 nt5.67□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 YAL045CYAL045C 309 nt5.67□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 ARC35YNR035C 1029 nt5.67□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 YNL295WYNL295W 1575 nt5.67□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 SLX5YDL013W 1860 nt5.66□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 ECM27YJR106W 2178 nt5.66□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 PET18YCR020C 648 nt5.66□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 MTR3YGR158C 753 nt5.66□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 YMR007WYMR007W 381 nt5.66□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 CSC1YLR241W 2349 nt5.65□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 RRP43YCR035C 1185 nt5.65□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 YUR1YJL139C 1287 nt5.65□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 YJL160CYJL160C 864 nt5.65□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 PAU19YMR325W 375 nt5.65□□□□□ -1.5
UPS3Q04006 ATG22YCL038C 1587 nt5.64□□□□□ -1.51
UPS3Q04006 MHP1YJL042W 4197 nt5.64□□□□□ -1.51
UPS3Q04006 THI4YGR144W 981 nt5.64□□□□□ -1.51
UPS3Q04006 YIL168WYIL168W 384 nt5.64□□□□□ -1.51
UPS3Q04006 TAH11YJR046W 1815 nt5.64□□□□□ -1.51
UPS3Q04006 YCP4YCR004C 744 nt5.63□□□□□ -1.51
UPS3Q04006 SWM1YDR260C 513 nt5.63□□□□□ -1.51
UPS3Q04006 DSC3YOR223W 879 nt5.63□□□□□ -1.51
UPS3Q04006 SNT309YPR101W 528 nt5.63□□□□□ -1.51
UPS3Q04006 CCT3YJL014W 1605 nt5.63□□□□□ -1.51
UPS3Q04006 BDS1YOL164W 1941 nt5.62□□□□□ -1.51
UPS3Q04006 BIM1YER016W 1035 nt5.62□□□□□ -1.51
UPS3Q04006 PSA1YDL055C 1086 nt5.61□□□□□ -1.51
UPS3Q04006 TDH1YJL052W 999 nt5.61□□□□□ -1.51
UPS3Q04006 GEF1YJR040W 2340 nt5.61□□□□□ -1.51
UPS3Q04006 RGD1YBR260C 2001 nt5.6□□□□□ -1.51
UPS3Q04006 VHT1YGR065C 1782 nt5.6□□□□□ -1.51
UPS3Q04006 KTR5YNL029C 1569 nt5.6□□□□□ -1.51
UPS3Q04006 PET494YNR045W 1470 nt5.6□□□□□ -1.51
UPS3Q04006 SPR1YOR190W 1338 nt5.6□□□□□ -1.51
UPS3Q04006 STS1YIR011C 960 nt5.6□□□□□ -1.51
UPS3Q04006 ERS1YCR075C 783 nt5.59□□□□□ -1.51
UPS3Q04006 OPI8YKR035C 642 nt5.59□□□□□ -1.51
UPS3Q04006 SUN4YNL066W 1263 nt5.59□□□□□ -1.51
UPS3Q04006 SKI2YLR398C 3864 nt5.58□□□□□ -1.52
UPS3Q04006 HOG1YLR113W 1308 nt5.58□□□□□ -1.52
UPS3Q04006 SPS1YDR523C 1473 nt5.58□□□□□ -1.52
UPS3Q04006 PSP2YML017W 1782 nt5.57□□□□□ -1.52
UPS3Q04006 NMT1YLR195C 1368 nt5.57□□□□□ -1.52
UPS3Q04006 AMN1YBR158W 1650 nt5.57□□□□□ -1.52
UPS3Q04006 SUF3tG(CCC)D 72 nt5.57□□□□□ -1.52
UPS3Q04006 CPT1YNL130C 1182 nt5.57□□□□□ -1.52
UPS3Q04006 RPL43AYPR043W 279 nt5.57□□□□□ -1.52
UPS3Q04006 PNS1YOR161C 1620 nt5.56□□□□□ -1.52
UPS3Q04006 PXL1YKR090W 2121 nt5.56□□□□□ -1.52
UPS3Q04006 CDC7YDL017W 1524 nt5.56□□□□□ -1.52
UPS3Q04006 OSM1YJR051W 1506 nt5.55□□□□□ -1.52
UPS3Q04006 ERV2YPR037C 591 nt5.55□□□□□ -1.52
UPS3Q04006 YPR127WYPR127W 1038 nt5.55□□□□□ -1.52
UPS3Q04006 AIM3YBR108W 2844 nt5.55□□□□□ -1.52
UPS3Q04006 RSA4YCR072C 1548 nt5.54□□□□□ -1.52
UPS3Q04006 UTR5YEL035C 501 nt5.54□□□□□ -1.52
UPS3Q04006 YJL213WYJL213W 996 nt5.54□□□□□ -1.52
UPS3Q04006 RMD9YGL107C 1941 nt5.53□□□□□ -1.52
UPS3Q04006 CCP1YKR066C 1086 nt5.53□□□□□ -1.52
UPS3Q04006 YMR074CYMR074C 438 nt5.53□□□□□ -1.52
UPS3Q04006 SDH8YBR269C 417 nt5.53□□□□□ -1.52
UPS3Q04006 RDR1YOR380W 1641 nt5.52□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 SKP1YDR328C 585 nt5.52□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 PET117YER058W 324 nt5.52□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 YNR014WYNR014W 639 nt5.52□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 HBN1YCL026C-B 582 nt5.52□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 ARG81YML099C 2643 nt5.52□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 TDP1YBR223C 1635 nt5.52□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 ADA2YDR448W 1305 nt5.51□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 IRC5YFR038W 2562 nt5.51□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 PHO85YPL031C 918 nt5.51□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 ALT2YDR111C 1524 nt5.51□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 RGT2YDL138W 2292 nt5.5□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 CIS3YJL158C 684 nt5.5□□□□□ -1.53
UPS3Q04006 CCW12YLR110C 402 nt5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 141.6 ms