Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sec1P97353 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sec1P97353 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sec1P97353 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sec1P97353 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sec1P97353 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sec1P97353 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sec1P97353 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sec1P97353 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sec1P97353 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sec1P97353 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sec1P97353 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sec1P97353 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sec1P97353 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sec1P97353 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sec1P97353 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sec1P97353 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sec1P97353 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sec1P97353 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sec1P97353 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sec1P97353 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sec1P97353 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sec1P97353 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sec1P97353 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sec1P97353 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sec1P97353 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sec1P97353 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sec1P97353 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sec1P97353 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sec1P97353 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sec1P97353 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sec1P97353 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sec1P97353 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sec1P97353 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sec1P97353 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sec1P97353 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sec1P97353 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sec1P97353 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sec1P97353 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sec1P97353 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec1P97353 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec1P97353 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec1P97353 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec1P97353 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec1P97353 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sec1P97353 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sec1P97353 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sec1P97353 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sec1P97353 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sec1P97353 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sec1P97353 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sec1P97353 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sec1P97353 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sec1P97353 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sec1P97353 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sec1P97353 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sec1P97353 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sec1P97353 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sec1P97353 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sec1P97353 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sec1P97353 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sec1P97353 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Sec1P97353 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sec1P97353 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sec1P97353 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sec1P97353 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sec1P97353 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sec1P97353 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sec1P97353 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sec1P97353 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec1P97353 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec1P97353 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec1P97353 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sec1P97353 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sec1P97353 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sec1P97353 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sec1P97353 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sec1P97353 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sec1P97353 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sec1P97353 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sec1P97353 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sec1P97353 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sec1P97353 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sec1P97353 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sec1P97353 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec1P97353 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec1P97353 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec1P97353 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec1P97353 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sec1P97353 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sec1P97353 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sec1P97353 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sec1P97353 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sec1P97353 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sec1P97353 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sec1P97353 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sec1P97353 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec1P97353 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec1P97353 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec1P97353 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms