Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nkx2-3P97334 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nkx2-3P97334 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nkx2-3P97334 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nkx2-3P97334 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Nkx2-3P97334 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nkx2-3P97334 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nkx2-3P97334 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nkx2-3P97334 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nkx2-3P97334 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nkx2-3P97334 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nkx2-3P97334 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nkx2-3P97334 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nkx2-3P97334 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nkx2-3P97334 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nkx2-3P97334 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nkx2-3P97334 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nkx2-3P97334 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nkx2-3P97334 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nkx2-3P97334 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Nkx2-3P97334 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nkx2-3P97334 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nkx2-3P97334 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nkx2-3P97334 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nkx2-3P97334 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nkx2-3P97334 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nkx2-3P97334 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nkx2-3P97334 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nkx2-3P97334 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nkx2-3P97334 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nkx2-3P97334 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nkx2-3P97334 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nkx2-3P97334 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nkx2-3P97334 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nkx2-3P97334 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nkx2-3P97334 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nkx2-3P97334 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nkx2-3P97334 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nkx2-3P97334 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nkx2-3P97334 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nkx2-3P97334 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nkx2-3P97334 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nkx2-3P97334 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nkx2-3P97334 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nkx2-3P97334 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nkx2-3P97334 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Nkx2-3P97334 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nkx2-3P97334 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nkx2-3P97334 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nkx2-3P97334 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nkx2-3P97334 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nkx2-3P97334 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nkx2-3P97334 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nkx2-3P97334 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Nkx2-3P97334 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nkx2-3P97334 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Nkx2-3P97334 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nkx2-3P97334 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nkx2-3P97334 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nkx2-3P97334 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nkx2-3P97334 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nkx2-3P97334 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nkx2-3P97334 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nkx2-3P97334 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nkx2-3P97334 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nkx2-3P97334 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nkx2-3P97334 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nkx2-3P97334 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Nkx2-3P97334 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nkx2-3P97334 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nkx2-3P97334 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Nkx2-3P97334 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nkx2-3P97334 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nkx2-3P97334 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nkx2-3P97334 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nkx2-3P97334 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nkx2-3P97334 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nkx2-3P97334 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nkx2-3P97334 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nkx2-3P97334 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Nkx2-3P97334 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nkx2-3P97334 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nkx2-3P97334 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Nkx2-3P97334 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nkx2-3P97334 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nkx2-3P97334 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nkx2-3P97334 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nkx2-3P97334 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nkx2-3P97334 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nkx2-3P97334 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nkx2-3P97334 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nkx2-3P97334 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nkx2-3P97334 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nkx2-3P97334 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nkx2-3P97334 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nkx2-3P97334 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nkx2-3P97334 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nkx2-3P97334 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nkx2-3P97334 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nkx2-3P97334 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms