Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otx2P80206 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otx2P80206 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otx2P80206 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Otx2P80206 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otx2P80206 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otx2P80206 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otx2P80206 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otx2P80206 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otx2P80206 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otx2P80206 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otx2P80206 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otx2P80206 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otx2P80206 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otx2P80206 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otx2P80206 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otx2P80206 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otx2P80206 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otx2P80206 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Otx2P80206 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otx2P80206 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Otx2P80206 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Otx2P80206 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Otx2P80206 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Otx2P80206 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otx2P80206 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otx2P80206 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otx2P80206 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Otx2P80206 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otx2P80206 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otx2P80206 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otx2P80206 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otx2P80206 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otx2P80206 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otx2P80206 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otx2P80206 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otx2P80206 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Otx2P80206 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Otx2P80206 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otx2P80206 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otx2P80206 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otx2P80206 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otx2P80206 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otx2P80206 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otx2P80206 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otx2P80206 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Otx2P80206 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Otx2P80206 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Otx2P80206 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Otx2P80206 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Otx2P80206 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Otx2P80206 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Otx2P80206 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Otx2P80206 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Otx2P80206 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Otx2P80206 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Otx2P80206 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Otx2P80206 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Otx2P80206 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Otx2P80206 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Otx2P80206 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Otx2P80206 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Otx2P80206 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Otx2P80206 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Otx2P80206 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Otx2P80206 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Otx2P80206 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Otx2P80206 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Otx2P80206 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Otx2P80206 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Otx2P80206 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Otx2P80206 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Otx2P80206 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms