Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA6P60900 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMA6P60900 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA6P60900 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA6P60900 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMA6P60900 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMA6P60900 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMA6P60900 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA6P60900 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA6P60900 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA6P60900 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA6P60900 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA6P60900 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA6P60900 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA6P60900 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA6P60900 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA6P60900 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA6P60900 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSMA6P60900 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSMA6P60900 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA6P60900 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA6P60900 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA6P60900 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA6P60900 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA6P60900 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA6P60900 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA6P60900 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA6P60900 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMA6P60900 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMA6P60900 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms