Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Paxbp1P58501 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Paxbp1P58501 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Paxbp1P58501 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms