Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NcanP55066 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NcanP55066 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NcanP55066 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NcanP55066 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NcanP55066 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NcanP55066 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NcanP55066 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NcanP55066 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NcanP55066 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NcanP55066 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NcanP55066 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NcanP55066 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NcanP55066 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NcanP55066 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NcanP55066 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NcanP55066 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NcanP55066 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NcanP55066 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NcanP55066 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NcanP55066 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NcanP55066 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NcanP55066 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NcanP55066 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NcanP55066 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NcanP55066 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NcanP55066 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NcanP55066 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NcanP55066 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NcanP55066 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NcanP55066 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NcanP55066 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NcanP55066 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NcanP55066 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NcanP55066 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NcanP55066 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NcanP55066 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NcanP55066 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NcanP55066 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NcanP55066 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NcanP55066 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NcanP55066 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NcanP55066 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NcanP55066 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NcanP55066 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NcanP55066 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NcanP55066 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NcanP55066 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NcanP55066 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NcanP55066 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NcanP55066 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NcanP55066 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NcanP55066 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NcanP55066 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NcanP55066 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NcanP55066 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NcanP55066 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NcanP55066 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NcanP55066 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NcanP55066 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NcanP55066 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NcanP55066 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NcanP55066 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NcanP55066 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NcanP55066 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NcanP55066 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NcanP55066 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NcanP55066 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NcanP55066 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NcanP55066 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NcanP55066 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NcanP55066 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NcanP55066 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NcanP55066 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NcanP55066 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NcanP55066 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NcanP55066 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NcanP55066 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NcanP55066 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NcanP55066 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NcanP55066 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NcanP55066 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NcanP55066 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NcanP55066 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NcanP55066 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NcanP55066 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NcanP55066 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NcanP55066 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NcanP55066 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NcanP55066 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NcanP55066 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NcanP55066 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NcanP55066 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NcanP55066 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NcanP55066 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NcanP55066 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NcanP55066 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NcanP55066 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NcanP55066 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NcanP55066 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
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