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Protein–RNA interactions for Protein: P53238
PEF1, Peflin, yeast
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335 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
PEF1
P53238
tL(UAA)B1
tL(UAA)B1
84 nt
6.67
□□□□□ -1.34
PEF1
P53238
tL(UAA)B2
tL(UAA)B2
84 nt
6.67
□□□□□ -1.34
PEF1
P53238
tL(UAA)D
tL(UAA)D
84 nt
6.67
□□□□□ -1.34
PEF1
P53238
SUP51
tL(UAA)J
84 nt
6.67
□□□□□ -1.34
PEF1
P53238
tL(UAA)K
tL(UAA)K
84 nt
6.67
□□□□□ -1.34
PEF1
P53238
tL(UAA)L
tL(UAA)L
84 nt
6.67
□□□□□ -1.34
PEF1
P53238
tL(UAA)N
tL(UAA)N
84 nt
6.67
□□□□□ -1.34
PEF1
P53238
CDC10
YCR002C
969 nt
6.66
□□□□□ -1.34
PEF1
P53238
KAE1
YKR038C
1161 nt
6.66
□□□□□ -1.34
PEF1
P53238
TAF11
YML015C
1041 nt
6.66
□□□□□ -1.34
PEF1
P53238
KTR4
YBR199W
1395 nt
6.66
□□□□□ -1.34
PEF1
P53238
YPR150W
YPR150W
522 nt
6.65
□□□□□ -1.34
PEF1
P53238
ELP4
YPL101W
1371 nt
6.65
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
YPR084W
YPR084W
1371 nt
6.65
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
RSC9
YML127W
1746 nt
6.64
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
MAL31
YBR298C
1845 nt
6.64
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
RMD8
YFR048W
1989 nt
6.64
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
TRP1
YDR007W
675 nt
6.64
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
ERP5
YHR110W
639 nt
6.64
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
TAD2
YJL035C
753 nt
6.64
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
HST2
YPL015C
1074 nt
6.64
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
CDS1
YBR029C
1374 nt
6.64
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
NOG2
YNR053C
1461 nt
6.64
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
YPT31
YER031C
672 nt
6.63
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
YMR206W
YMR206W
942 nt
6.63
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
RHO1
YPR165W
630 nt
6.63
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
TKL2
YBR117C
2046 nt
6.62
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
ERP2
YAL007C
648 nt
6.62
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
PRE2
YPR103W
864 nt
6.62
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
DIP5
YPL265W
1827 nt
6.62
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
FRE5
YOR384W
2085 nt
6.61
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
TOS1
YBR162C
1368 nt
6.61
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
RRP1
YDR087C
837 nt
6.61
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
DPH5
YLR172C
903 nt
6.61
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
RRN10
YBL025W
438 nt
6.61
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
COA2
YPL189C-A
207 nt
6.61
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
THI73
YLR004C
1572 nt
6.61
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
APM4
YOL062C
1476 nt
6.6
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
SEC23
YPR181C
2307 nt
6.6
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
YIR018C-A
YIR018C-A
138 nt
6.6
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
MRP7
YNL005C
1116 nt
6.6
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
YBR284W
YBR284W
2394 nt
6.6
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
SHC1
YER096W
1539 nt
6.6
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
ATP2
YJR121W
1536 nt
6.6
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
KIN1
YDR122W
3195 nt
6.59
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
HXT2
YMR011W
1626 nt
6.59
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
YGR137W
YGR137W
375 nt
6.59
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
TDH1
YJL052W
999 nt
6.59
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
ADE1
YAR015W
921 nt
6.59
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
YOR268C
YOR268C
399 nt
6.59
□□□□□ -1.35
PEF1
P53238
WSC3
YOL105C
1671 nt
6.58
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
NUP57
YGR119C
1626 nt
6.58
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
UTP6
YDR449C
1323 nt
6.58
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
YIL168W
YIL168W
384 nt
6.58
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
RCF1
YML030W
480 nt
6.58
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
YNR048W
YNR048W
1182 nt
6.58
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
EFM1
YHL039W
1758 nt
6.58
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
ARO10
YDR380W
1908 nt
6.58
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
EHT1
YBR177C
1356 nt
6.57
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
YIL092W
YIL092W
1902 nt
6.57
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
EDC2
YER035W
438 nt
6.57
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
YJL043W
YJL043W
774 nt
6.57
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
ICE2
YIL090W
1476 nt
6.57
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
TFC6
YDR362C
2019 nt
6.57
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
CHS5
YLR330W
2016 nt
6.56
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
PUP3
YER094C
618 nt
6.56
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
DRS1
YLL008W
2259 nt
6.56
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
PMT1
YDL095W
2454 nt
6.55
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
FPR2
YDR519W
408 nt
6.55
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
GET2
YER083C
858 nt
6.55
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
CKB1
YGL019W
837 nt
6.55
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
SMK1
YPR054W
1167 nt
6.55
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
SPS22
YCL048W
1392 nt
6.55
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
GTT3
YEL017W
1014 nt
6.54
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
HHY1
YEL059W
309 nt
6.54
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
GNA1
YFL017C
480 nt
6.54
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
YJL107C
YJL107C
1164 nt
6.54
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
YBL081W
YBL081W
1107 nt
6.54
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
NUP53
YMR153W
1428 nt
6.53
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
OPT1
YJL212C
2400 nt
6.53
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
ARO3
YDR035W
1113 nt
6.53
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
YOR041C
YOR041C
432 nt
6.53
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
RSM23
YGL129C
1353 nt
6.53
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
PET494
YNR045W
1470 nt
6.53
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
IES1
YFL013C
2079 nt
6.53
□□□□□ -1.36
PEF1
P53238
PIC2
YER053C
903 nt
6.52
□□□□□ -1.37
PEF1
P53238
CBT1
YKL208W
816 nt
6.52
□□□□□ -1.37
PEF1
P53238
FUS3
YBL016W
1062 nt
6.52
□□□□□ -1.37
PEF1
P53238
MRPL24
YMR193W
777 nt
6.52
□□□□□ -1.37
PEF1
P53238
AVL9
YLR114C
2295 nt
6.52
□□□□□ -1.37
PEF1
P53238
JHD1
YER051W
1479 nt
6.52
□□□□□ -1.37
PEF1
P53238
RUP1
YOR138C
2016 nt
6.51
□□□□□ -1.37
PEF1
P53238
MMS21
YEL019C
804 nt
6.51
□□□□□ -1.37
PEF1
P53238
NAT5
YOR253W
531 nt
6.51
□□□□□ -1.37
PEF1
P53238
ATP4
YPL078C
735 nt
6.51
□□□□□ -1.37
PEF1
P53238
PDC5
YLR134W
1692 nt
6.51
□□□□□ -1.37
PEF1
P53238
PEX28
YHR150W
1740 nt
6.5
□□□□□ -1.37
PEF1
P53238
HXT8
YJL214W
1710 nt
6.5
□□□□□ -1.37
PEF1
P53238
GLN3
YER040W
2193 nt
6.5
□□□□□ -1.37
PEF1
P53238
PRP40
YKL012W
1752 nt
6.5
□□□□□ -1.37
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