Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRPC1P48995 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRPC1P48995 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC1P48995 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC1P48995 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC1P48995 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC1P48995 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC1P48995 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC1P48995 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC1P48995 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC1P48995 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC1P48995 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC1P48995 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC1P48995 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC1P48995 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC1P48995 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC1P48995 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms