Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	POR2	YIL114C	846 nt		7.26	□□□□□ -1.25
ATG12	P38316	LIP5	YOR196C	1245 nt		7.26	□□□□□ -1.25
ATG12	P38316	ERG24	YNL280C	1317 nt		7.26	□□□□□ -1.25
ATG12	P38316	CAN1	YEL063C	1773 nt		7.25	□□□□□ -1.25
ATG12	P38316	PET117	YER058W	324 nt		7.24	□□□□□ -1.25
ATG12	P38316	POB3	YML069W	1659 nt		7.24	□□□□□ -1.25
ATG12	P38316	FCY22	YER060W-A	1593 nt		7.24	□□□□□ -1.25
ATG12	P38316	CIA1	YDR267C	993 nt		7.23	□□□□□ -1.25
ATG12	P38316	RTC4	YNL254C	1206 nt		7.23	□□□□□ -1.25
ATG12	P38316	TOD6	YBL054W	1578 nt		7.23	□□□□□ -1.25
ATG12	P38316	YOL046C	YOL046C	675 nt		7.22	□□□□□ -1.25
ATG12	P38316	YPR076W	YPR076W	375 nt		7.22	□□□□□ -1.25
ATG12	P38316	YCL049C	YCL049C	939 nt		7.22	□□□□□ -1.25
ATG12	P38316	AQR1	YNL065W	1761 nt		7.21	□□□□□ -1.25
ATG12	P38316	RDR1	YOR380W	1641 nt		7.21	□□□□□ -1.26
ATG12	P38316	HOC1	YJR075W	1191 nt		7.21	□□□□□ -1.26
ATG12	P38316	ENB1	YOL158C	1821 nt		7.21	□□□□□ -1.26
ATG12	P38316	EXG2	YDR261C	1689 nt		7.21	□□□□□ -1.26
ATG12	P38316	RSC4	YKR008W	1878 nt		7.21	□□□□□ -1.26
ATG12	P38316	FCY2	YER056C	1602 nt		7.2	□□□□□ -1.26
ATG12	P38316	YJL163C	YJL163C	1668 nt		7.2	□□□□□ -1.26
ATG12	P38316	SUN4	YNL066W	1263 nt		7.2	□□□□□ -1.26
ATG12	P38316	NUP57	YGR119C	1626 nt		7.19	□□□□□ -1.26
ATG12	P38316	GPD1	YDL022W	1176 nt		7.19	□□□□□ -1.26
ATG12	P38316	LIA1	YJR070C	978 nt		7.19	□□□□□ -1.26
ATG12	P38316	BNA3	YJL060W	1335 nt		7.19	□□□□□ -1.26
ATG12	P38316	COX15	YER141W	1461 nt		7.18	□□□□□ -1.26
ATG12	P38316	SPG1	YGR236C	288 nt		7.18	□□□□□ -1.26
ATG12	P38316	YNR001W-A	YNR001W-A	219 nt		7.18	□□□□□ -1.26
ATG12	P38316	PLB2	YMR006C	2121 nt		7.18	□□□□□ -1.26
ATG12	P38316	HTZ1	YOL012C	405 nt		7.17	□□□□□ -1.26
ATG12	P38316	CDC7	YDL017W	1524 nt		7.17	□□□□□ -1.26
ATG12	P38316	GAL83	YER027C	1254 nt		7.16	□□□□□ -1.26
ATG12	P38316	LOT6	YLR011W	576 nt		7.16	□□□□□ -1.26
ATG12	P38316	FIT2	YOR382W	462 nt		7.16	□□□□□ -1.26
ATG12	P38316	PPH21	YDL134C	1110 nt		7.15	□□□□□ -1.26
ATG12	P38316	PMP3	YDR276C	168 nt		7.15	□□□□□ -1.26
ATG12	P38316	MRPL35	YDR322W	1104 nt		7.15	□□□□□ -1.26
ATG12	P38316	YPL136W	YPL136W	369 nt		7.15	□□□□□ -1.26
ATG12	P38316	SUF3	tG(CCC)D	72 nt		7.14	□□□□□ -1.27
ATG12	P38316	AGX1	YFL030W	1158 nt		7.14	□□□□□ -1.27
ATG12	P38316	YMR074C	YMR074C	438 nt		7.14	□□□□□ -1.27
ATG12	P38316	PGI1	YBR196C	1665 nt		7.14	□□□□□ -1.27
ATG12	P38316	ALR1	YOL130W	2580 nt		7.14	□□□□□ -1.27
ATG12	P38316	AIM20	YIL158W	615 nt		7.13	□□□□□ -1.27
ATG12	P38316	YNR005C	YNR005C	405 nt		7.13	□□□□□ -1.27
ATG12	P38316	SSC1	YJR045C	1965 nt		7.12	□□□□□ -1.27
ATG12	P38316	GGC1	YDL198C	903 nt		7.12	□□□□□ -1.27
ATG12	P38316	OPI7	YDR360W	435 nt		7.11	□□□□□ -1.27
ATG12	P38316	SNF4	YGL115W	969 nt		7.11	□□□□□ -1.27
ATG12	P38316	ERG27	YLR100W	1044 nt		7.11	□□□□□ -1.27
ATG12	P38316	YLR184W	YLR184W	348 nt		7.11	□□□□□ -1.27
ATG12	P38316	RFS1	YBR052C	633 nt		7.11	□□□□□ -1.27
ATG12	P38316	BRN1	YBL097W	2265 nt		7.11	□□□□□ -1.27
ATG12	P38316	APE4	YHR113W	1473 nt		7.11	□□□□□ -1.27
ATG12	P38316	RPL43A	YPR043W	279 nt		7.1	□□□□□ -1.27
ATG12	P38316	FRT1	YOR324C	1809 nt		7.1	□□□□□ -1.27
ATG12	P38316	ATO2	YNR002C	849 nt		7.09	□□□□□ -1.27
ATG12	P38316	YCR041W	YCR041W	333 nt		7.08	□□□□□ -1.28
ATG12	P38316	DMC1	YER179W	1005 nt		7.08	□□□□□ -1.28
ATG12	P38316	YOR012W	YOR012W	414 nt		7.08	□□□□□ -1.28
ATG12	P38316	ASR1	YPR093C	867 nt		7.08	□□□□□ -1.28
ATG12	P38316	YDR306C	YDR306C	1437 nt		7.08	□□□□□ -1.28
ATG12	P38316	PMA2	YPL036W	2844 nt		7.08	□□□□□ -1.28
ATG12	P38316	FMP40	YPL222W	2067 nt		7.07	□□□□□ -1.28
ATG12	P38316	YOL099C	YOL099C	492 nt		7.07	□□□□□ -1.28
ATG12	P38316	PHO85	YPL031C	918 nt		7.07	□□□□□ -1.28
ATG12	P38316	NUP84	YDL116W	2181 nt		7.07	□□□□□ -1.28
ATG12	P38316	IMG1	YCR046C	510 nt		7.06	□□□□□ -1.28
ATG12	P38316	YIL029W-A	YIL029W-A	372 nt		7.05	□□□□□ -1.28
ATG12	P38316	SCS22	YBL091C-A	528 nt		7.05	□□□□□ -1.28
ATG12	P38316	YLR112W	YLR112W	420 nt		7.04	□□□□□ -1.28
ATG12	P38316	CTA1	YDR256C	1548 nt		7.03	□□□□□ -1.28
ATG12	P38316	LCL3	YGL085W	825 nt		7.03	□□□□□ -1.28
ATG12	P38316	YKL153W	YKL153W	510 nt		7.03	□□□□□ -1.28
ATG12	P38316	AIM2	YAL049C	741 nt		7.03	□□□□□ -1.28
ATG12	P38316	NTG2	YOL043C	1143 nt		7.03	□□□□□ -1.28
ATG12	P38316	PUS7	YOR243C	2031 nt		7.03	□□□□□ -1.28
ATG12	P38316	CTF3	YLR381W	2202 nt		7.03	□□□□□ -1.28
ATG12	P38316	GNP1	YDR508C	1992 nt		7.02	□□□□□ -1.29
ATG12	P38316	RPL2B	YIL018W	765 nt		7.02	□□□□□ -1.29
ATG12	P38316	MHP1	YJL042W	4197 nt		7.01	□□□□□ -1.29
ATG12	P38316	MRPL19	YNL185C	477 nt		7.01	□□□□□ -1.29
ATG12	P38316	IRC5	YFR038W	2562 nt		7.01	□□□□□ -1.29
ATG12	P38316	THR1	YHR025W	1074 nt		7	□□□□□ -1.29
ATG12	P38316	YLL056C	YLL056C	897 nt		7	□□□□□ -1.29
ATG12	P38316	TAF9	YMR236W	474 nt		7	□□□□□ -1.29
ATG12	P38316	MRPS18	YNL306W	654 nt		7	□□□□□ -1.29
ATG12	P38316	YPR127W	YPR127W	1038 nt		7	□□□□□ -1.29
ATG12	P38316	ILV6	YCL009C	930 nt		7	□□□□□ -1.29
ATG12	P38316	SAL1	YNL083W	1485 nt		6.99	□□□□□ -1.29
ATG12	P38316	YCR049C	YCR049C	447 nt		6.99	□□□□□ -1.29
ATG12	P38316	HPT1	YDR399W	666 nt		6.99	□□□□□ -1.29
ATG12	P38316	HHY1	YEL059W	309 nt		6.99	□□□□□ -1.29
ATG12	P38316	ASF1	YJL115W	840 nt		6.99	□□□□□ -1.29
ATG12	P38316	MDH1	YKL085W	1005 nt		6.99	□□□□□ -1.29
ATG12	P38316	CRH1	YGR189C	1524 nt		6.99	□□□□□ -1.29
ATG12	P38316	PAB1	YER165W	1734 nt		6.98	□□□□□ -1.29
ATG12	P38316	YGR068W-A	YGR068W-A	96 nt		6.98	□□□□□ -1.29
ATG12	P38316	PAC10	YGR078C	600 nt		6.98	□□□□□ -1.29

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