Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1BP36896 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACVR1BP36896 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACVR1BP36896 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms