Protein–RNA interactions for Protein: P24699

Myf5, Myogenic factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf5P24699 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myf5P24699 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myf5P24699 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myf5P24699 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myf5P24699 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myf5P24699 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myf5P24699 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myf5P24699 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myf5P24699 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myf5P24699 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Myf5P24699 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Myf5P24699 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Myf5P24699 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Myf5P24699 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Myf5P24699 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Myf5P24699 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Myf5P24699 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Myf5P24699 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Myf5P24699 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Myf5P24699 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Myf5P24699 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Myf5P24699 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Myf5P24699 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Myf5P24699 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Myf5P24699 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myf5P24699 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myf5P24699 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myf5P24699 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myf5P24699 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myf5P24699 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myf5P24699 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myf5P24699 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myf5P24699 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myf5P24699 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myf5P24699 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myf5P24699 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myf5P24699 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myf5P24699 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myf5P24699 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myf5P24699 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myf5P24699 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myf5P24699 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myf5P24699 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myf5P24699 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myf5P24699 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myf5P24699 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myf5P24699 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myf5P24699 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myf5P24699 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myf5P24699 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myf5P24699 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Myf5P24699 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms