Protein–RNA interactions for Protein: P08727

KRT19, Keratin, type I cytoskeletal 19, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT19P08727 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT19P08727 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT19P08727 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT19P08727 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT19P08727 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT19P08727 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT19P08727 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT19P08727 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT19P08727 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT19P08727 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT19P08727 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT19P08727 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT19P08727 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT19P08727 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT19P08727 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT19P08727 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT19P08727 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT19P08727 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT19P08727 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT19P08727 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT19P08727 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT19P08727 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT19P08727 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT19P08727 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT19P08727 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT19P08727 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT19P08727 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT19P08727 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRT19P08727 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT19P08727 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT19P08727 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT19P08727 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT19P08727 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT19P08727 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT19P08727 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT19P08727 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT19P08727 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT19P08727 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT19P08727 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT19P08727 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT19P08727 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT19P08727 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT19P08727 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT19P08727 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT19P08727 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT19P08727 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT19P08727 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT19P08727 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT19P08727 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT19P08727 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT19P08727 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT19P08727 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT19P08727 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT19P08727 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT19P08727 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT19P08727 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT19P08727 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT19P08727 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT19P08727 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT19P08727 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT19P08727 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT19P08727 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT19P08727 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT19P08727 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT19P08727 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT19P08727 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT19P08727 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT19P08727 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT19P08727 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT19P08727 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT19P08727 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT19P08727 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT19P08727 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT19P08727 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT19P08727 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT19P08727 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT19P08727 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT19P08727 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT19P08727 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT19P08727 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT19P08727 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT19P08727 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT19P08727 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT19P08727 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT19P08727 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT19P08727 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT19P08727 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT19P08727 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT19P08727 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT19P08727 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT19P08727 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT19P08727 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT19P08727 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT19P08727 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT19P08727 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT19P08727 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT19P08727 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT19P08727 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT19P08727 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT19P08727 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms