Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMCC1O94876 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMCC1O94876 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCC1O94876 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCC1O94876 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms